Scientometrijska analiza ciljanog signalnog puta rapamicina kod sisavaca u bubrežnoj bolesti od 1986. do 2020. godine, 2. dio

Pregled najznačajnijih autora i literature 

A total of 14,045 researchers had published the 2,585 manuscripts and the number of authors in every paper on average was 5.43. We used CiteSpace and VOSviewer to analyze co-authorship and citation networks among authors and to reveal the most highly cited researchers and collaboration among researchers. "Key researcher" was referred to as someone whose literature had been cited more than 500 times (global citation score >500). Čvorovi su ukazivali na različite istraživače. Linije između čvorova predstavljale su saradnju između autora, a veličina čvora je pokazivala broj radova koje je autor objavio (Slika 3C, D). Linehan WM, Schmidt LS, Sommerer C, Kasinath BS, Aburatani H i Baba M dali su izuzetan doprinos istraživanju mTOR signalnog puta ubolest bubrega. Linehan WM je objavio 24 rada u ovoj oblasti istraživanja. Linehan WM, Schmidt LS i Huber TB, koji se mogu smatrati liderima u ovoj oblasti istraživanja, dobili su preko 1,000 citata. Linehan WM i Aburatani H su sarađivali na mnogim člancima, ali njihova saradnja sa DJ-em Kwiatkowski nije bila tako česta (slika 3D). 2.585 vrsta literature o mTOR signalnim putevima ubolest bubregatakođer su citirali jedni druge ili nekoliko drugih studija u svojim referencama. Koristili smo CiteSpace da analiziramo 71.544 referenci njihovih kompozicija i proizvedemo 20 najjačih citatnih rafala i modernizovanu mrežu kocitata (Slika 3E, F). Cifra citiranosti ovih publikacija naglo je porasla tokom perioda, što je otkrilo brzo prihvatanje i širenje u specifičnim istraživanjima i zauzelo veoma važne pozicije u okviru znanja.

Vizualizacija ključnih riječi i MeSH pojmova

Učestalost pojavljivanja i vremenski trend ključnih riječi i MeSH pojmova vizualizirani su programima CiteSpace i VOSviewer. Da biste izdvojili ključne koncepte mTOR-a ubolest bubrega, koristili smo sistem Carrot2 za analizu glavnih tema. U crvenom okviru je bilo 6 najboljih ključnih riječi, koje su predstavljale najveću stopu pojavljivanja sa "Primatelji transplantirani", "Istraživali efektemTOR", "Akt Expression", "Target Genes", "Mammalian Target of Rapamycin Signaling" i "Therapy to a mammalian Target of Rapamycin" (Slika 4A). Na osnovu CiteSpace-a, mreža kocitata je segmentirana u različite različite klastere od naslovi citiranih članaka (slika 4B) Mrežna vizualizacija ključnih riječi i klastersko istraživanje mTOR-a zasnovano je na programu VOSviewer (slika 4C, D).

Softver CiteSpacea korišten je za analizu prikaza vremenske zone i prikaza vremenske linijemTORsignalni put ubolest bubregamreža kocitata. Vrijeme objavljivanja je otkriveno na vrhu prikaza. Slika za čvorove u horizontalnoj liniji predstavljala je važnost polja istraživanja i veza između čvorova odražavala citiranje. Prikaz vremenske linije je takođe pokazao pojavu, popularnost i pad istraživačkih subjekata u najtipičnijim publikacijama.

Slika 4Vizualizacija ključnih riječi i MeSH pojmova. (A) Analiza ključnih riječi za mTOR signalni put kod bolesti bubrega. (B) Grupna analiza mreže kocitiranja za mTOR signalni put kod bolesti bubrega. (C) Mrežna vizualizacija ključnih riječi. (D) Toplotna mapa ključnih riječi.

U međuvremenu, klasteri su odražavali vremenske karakteristike istraživačkih područja u prikazu vremenske linije. Razvoj klastera 10 (vezujući protein) pokazao je rano istraživanje mTOR puta ububregistraživanje koje se fokusiralo na vezujući protein, koje se dogodilo najranije. Klaster 0 (transplantacija bubrega), klaster 1 (autosomno dominantni policističnibolest bubrega), klaster 4 (karcinom bubrežnih ćelija), klaster 5 (dijabetička nefropatija), klaster 7 (renalni angiomiolipom) i klaster 13 (neglikemijske bolesti) bili su trenutne granice i fokusi istraživanja (Slika 5A). Rezultati analize vremenskih linija ključnih riječi otkrili su inhibitor kalcineurina, dijabetička nefropatija, autosomno dominantna policistična bolestbolest bubrega,i kompleks tuberozne skleroze (Slika 5B). Trenutna istraživanja se fokusiraju na mehanizme i komplikacijebolest bubrega. Prikaz vremenske zone čvorova klastera ilustrovan je kada je mreža kocitata citirala publikacije, koje bi takođe mogle pokazati napredak istraživanja tokom vremena (slika 5C). A središnja veza između vremenskih zona otkrivala je u kojoj mjeri je poruka nedostajala ili je poruka priznata da bi stimulirala otkrića i promovirala istrage. Kada bi bilo više vrsta literature u vizualizaciji vremenske zone, to bi bio značajan period (slika 5C).

Dual-map analiza je korištena za ukazivanje i stvaranje naučnih veza i doprinosa. Citirajući obris je na lijevoj, a citirani obris je na desnoj polovini. Linija asocijacije citata u putanji od jedne regije do druge bi ilustrovala razumijevanje međuspecijalističkih odnosa, čime bi potaknula veze i znanje o različitim istraživačkim poljima (Slika 5D).

Slika 5Prikaz vremenske zone čvorova klastera i vizualizacija vremenske linije ključnih riječi i MeSH pojmova. (A) Vizualizacija vremenske linije termina od 1986. do 2020. (B) Vizualizacija vremenske linije ključnih riječi od 1986. do 2020. (C) Vizualizacija prikaza vremenske zone čvorova klastera. (D) Dual-map preklapanja publikacija o mTOR u bolesti bubrega.

Diskusija 

Za razliku od tradicionalnih pregleda, bibliometrijska analiza može sistematski obraditi rukopise u srodnim istraživačkim područjima kako bi se dobili intuitivniji i jasniji rezultati. Za nove istraživače u određenim oblastima, može biti od pomoći da prate trenutne fokuse istraživanja i sveukupne trendove i otkriju značajne vrste literature u ovoj oblasti. Nadalje, lak je i jednostavan za korištenje trenutnim softverom za bibliometrijsku analizu. U trenutnom istraživanju predstavili smo bibliometrijsku analizu u vezi sa mTOR signalnim putem ubolest bubrega.

Prema relevantnim studijama, posljednjih godina, istraživanja upotrebe matičnih stanica i kineskog biljnog lijeka za liječenjebolesti bubregaje zadobila veliku pažnju. Glavni mehanizam ove dvije terapije je promicanje popravke oštećenog bubrežnog tkiva izaštititi preostale bubrežne funkcije.

Kineski biljni lijek,cistanche, koristi se u tradicionalnoj kineskoj medicini za liječenje raznih kroničnihbolesti bubregaod davnina. Izvještava se dacistancheima potencijal da smanji upalu,smanjiti fibrozu bubregai podstiču sintezu komponenti ekstracelularnog matriksa. Otkriveno je da su ovi efekti posljedica njegovih bioaktivnih komponenti, uključujući mnoge fenolne tvari, triterpenoide i kumarine.

Kliknite ovdje da biste saznali više o organskom cistanhu za bubrežnu bolest

Pitajte za više:

david.deng@wecistanche.com WhatApp:86 13632399501

S druge strane, tehnologija matičnih ćelija izazvala je revoluciju u medicinskoj praksi. Istraživanja su pokazala da se matične stanice mogu diferencirati u različite vrste bubrežnih stanica i obavljati terapijske aktivnosti, uključujući zaštitu preostalih funkcionalnih bubrežnih tkiva, usporavanje fibroze tkiva i popravku oštećenog bubrežnog tkiva.

Konačno, kombinacija tradicionalne kineske medicine sa modernom naukom mogla bi biti ključ za liječenje raznihbolesti bubrega.Ovu strategiju je postupno prihvatila medicinska zajednica i studije su već pokazale da kombinovana terapija cistanche i tretman matičnim ćelijama može značajno smanjiti stopu smrtnostibolesti bubrega. 

U zaključku, upotreba cistanchea i tretmana matičnim stanicama u liječenjubolesti bubregapokazuje veliki potencijal i zahtijeva daljnja istraživanja. Kombinirana terapija ova dva tretmana mogla bi pružiti poboljšanu opciju liječenja za one koji se suočavajubolesti bubrega.

Na osnovu rezultata, iz WoSCC-a je izdvojeno ukupno 2.585 vrsta literature sa 71.544 reference. Broj rukopisa se povećava iz godine u godinu. Iako je mTOR signalni put grana cjelokupnog istraživanjabubrezi, njen istraživački trend se u posljednje vrijeme postepeno povećavao (Slika 2A). SAD, Kina i Njemačka su istaknutije u ovoj oblasti sa 55,7 posto publikacija. Pet od 20 najproduktivnijih institucija nalazi se u Sjedinjenim Državama (Tabela 1), što pokazuje da je kvalitet literature koju izdaju američke institucije viši. Istraživačke institucije, kao što je Univerzitet Harvard (Slika 2F, G, H), relativno su zrele u ovoj specifičnoj oblasti i mogu se smatrati značajnim institucijama za učenje i dalju saradnju. Ovi rezultati pokazuju da SAD zauzimaju vodeću poziciju u mTOR signalnom putu ubolest bubrega, uglavnom se ogleda u međunarodnoj saradnji, ukupnim citatima i broju publikacija. Primjetno je, u poređenju sa Njemačkom i Engleskom, publikacije drugih evropskih zemalja, poput Italije i Švicarske, dramatično su porasle nakon 2014. godine, što otkriva da će se razvijenije zemlje/regije posvetiti daljem istraživanju u ovoj oblasti (Slika 2E).

Časopisi u istom klasteru posjeduju isto područje istraživanja. Koristeći funkciju softvera VOSviewer, podijelili smo prvih 100 časopisa u tri klastera (slika 3B). Na osnovu CiteSpace-a, otkrivena su cjelokupna istraživačka polja i podijeljena u četrnaest podskupova, a sedam najvećih klastera prikazano je na slici 4B, uključujući klaster 0 "transplantacija bubrega", klaster 1 "autosomno dominantni policističnibolest bubrega", klaster 2 "transplantacija bubrega", klaster 3 "karcinom bubrežnih ćelija", klaster 4 "hamartin", klaster 5 "autofagija" i klaster 6 "kompleks tuberozne skleroze". Klaster 3 "karcinom bubrežnih ćelija" ukazuje da je mTOR značajan u istraživanje karcinoma bubrežnih ćelija (RCC) i da antiproliferativno svojstvo mTOR inhibitora može suzbiti rast tumora RCC zauzima sedmo i deveto među muškarcima i ženama, a broj novih slučajeva raka će se povećati u budućnosti (29) .Hirurška resekcija je glavna metoda za liječenje tumora koji su ograničeni na bubreg.Oko jedne trećine pacijenata ima udaljene metastaze, a većina slučajeva je neizlječiva.Interferon se široko koristi u translokacijskom karcinomu bubrežnih stanica, ali njegova efikasnost i tolerancija su ograničeni. Stoga, novi terapijski ciljevi mTOR-a dolaze u fokus (30,31). Koristili smo CiteSpace da izvršimo kocitatnu analizu i odredili nekoliko literature o prekretnicama (Slika 3F). Na primjer, Linehan WM je otkrio genetsku osnovu RCC-a i uloga mTOR puta u njegovoj patogenezi (32). Hudes et al. takođe je procenio temsirolimus kao mTOR inhibitor za RCC (33). Serra et al. procijenio sirolimus i rast bubrega kod autosomno dominantnih policističnihbolest bubrega(34). Rad Laplantea et al. ima najveći broj citata (Slika 3F): mTOR signalizacija u kontroli rasta i bolesti (4). Shillingford et al. razradio je da inhibicija mTOR puta može preokrenuti bubrežnu cistogenezu kod policističnihbolest bubrega(35). Rukopis je uključen u klaster 1 "autosomno dominantni policističnibolest bubrega" i klaster 5 "autofagija".

Čitaoci mogu autoritativno prepoznati mehanizam mTOR utransplantacija bubrega, karcinom bubrega i kompleks tuberozne skleroze bubrega i njihovo liječenjebolest bubregakroz ove važne rukopise. Prema slikama 5A i B, razvoj mTOR-a ubolest bubregau određenom vremenu je jasno prikazano. Inhibitor kalcineurina je žarište istraživanja i istraživači su ilustrovali poređenje inhibitora kalcineurina i mTOR inhibitora za liječenjebolest bubrega(13,36,37). Osim toga, istraživanje mTOR signalnog puta ubolest bubregamože početi da se odnosi na mTOR (38-40). Koristili smo VOSviewer i Carrot2 da prepoznamo ključne riječi od značaja (Slika 4A, C, D). Među žarišnim tačkama na slici 4C, D, postoji više naziva lijekova, kao što su rapamicin, sirolimus, everolimus, itd. Godine 1999., Američka agencija za hranu i lijekove (FDA) odobrila je stavljanje na tržište rapamicina kao nove opcije liječenja za sprječavanje odbacivanja organa kod primaoca transplantacije bubrega (41). Stoga su istraživanja o rapamicinu uglavnom koncentrisana oko 2000. godine (slika 4C). U martu 2010. everolimus je dobio odobrenje američke FDA i Evropske agencije za lijekove za liječenje uznapredovalog RCC-a i transplantacije bubrega (42). Stoga se istraživanje everolimusa i transplantacije bubrega uglavnom fokusiralo na 2010. godinu (slika 4C). Analizirali smo vremenske trendove ključnih riječi od strane CiteSpace-a (Slika 5A, B, C). dijabetička nefropatija,transplantacija bubrega, autosomno dominantna policistična bolest bubrega, kompleks tuberozne skleroze, karcinom bubrežnih stanica i autofagija mogli bi biti fokus istraživanja u sljedećih nekoliko godina.

Prema preklapanjima dvostruke mape (slika 5D), putanja citata nam govori da su medicina i biologija dominantne regije mTOR signalnog puta ubolest bubrega, a mTOR ima malo veze s drugim disciplinama. Chiew et al. je prikazao trodimenzionalnu platformu koristeći senzor kaspaze-3 zasnovan na prijenosu energije fluorescentne rezonance za otkrivanje apoptotičke sposobnosti mTOR inhibitora (43). Uz daljnja istraživanja o mTOR signalizaciji ubolest bubrega, na kraju će biti uključeni i drugi subjekti. Međutim, ova studija ima neka ograničenja koja se moraju uzeti u obzir prilikom analize rezultata istraživanja. Prvo, literatura se izdvaja samo iz WoSCC baze podataka, što bi moglo rezultirati nepotpunim pronalaženjem dokumenta. Drugo, otkrili smo neke klastere, kao što su hemangiom jetre i epitelne stanice debelog crijeva, koje nisu blisko povezane sbolest bubrega.

Zaključci

Buduća istraživačka žarišta će utjeloviti dijabetičku nefropatiju,bubregtransplantacija, autosomno dominantni policističnibolest bubrega,kompleks tuberozne skleroze, karcinom bubrežnih ćelija i autofagija. Zasnovano na različitim naučnim metodama, može pružiti smjer budućeg istraživanja onima koji tek dolaze u ovu oblast.

Priznanja

Finansiranje: Ovaj rad je podržala Nacionalna fondacija za prirodne nauke Kine (broj granta 81703851).

Reference

1. Aleman JO, Eusebi LH, Ricciardiello L, et al. Mehanizmi gastrointestinalne neoplazije izazvane gojaznošću. Gastroenterologija 2014;146:357-73.

2. D'Agati VD, Chagnac A, de Vries AP, et al. Glomerulopatija povezana s pretilošću: kliničke i patološke karakteristike i patogeneza. Nat Rev Nephrol 2016;12:453-71.

3. Blandino-Rosano M, Barbaresso R, Jimenez-Palomares M, et al. Gubitak mTORC1 signalizacije narušava homeostazu beta ćelija i procesiranje insulina. Nat Commun 2017;8:16014.

4. Laplante M, Sabatini DM. mTOR signalizacija u kontroli rasta i bolesti. Cell 2012;149:274-93.

5. Li J, Kim SG, Blenis J. Rapamycin: jedan lijek, mnogo efekata. Cell Metab 2014;19:373-9.

6. Uno K, Yamada T, Ishigaki Y, et al. Signalni put zavisan od amino kiselina/mTOR/S6K modulira sistemski metabolizam lipida putem neuronskih signala. Nat Commun 2015; 6:7940.

7. Kim K, Qiang L, Hayden MS, et al. mTORC1- nezavisan Raptor sprječava steatozu jetre stabilizirajući PHLPP2. Nat Commun 2016;7:10255.

8. Han J, Li E, Chen L, et al. CREB koaktivator CRTC2 kontroliše metabolizam lipida u jetri regulacijom SREBP1. Priroda 2015;524:243-6.

9. Lipton JO, Sahin M. Neurologija mTOR-a. Neuron 2014;84:275-91.

10. Bockaert J, Marin P. mTOR in Brain Physiology and Pathologies. Physiol Rev 2015;95:1157-87.

11. Crino PB. mTOR signalna kaskada: asfaltiranje novih puteva za liječenje neuroloških bolesti. Nat Rev Neurol 2016;12:379-92.

12. Ardestani A, Lupse B, Kido Y, et al. mTORC1 signalizacija: mač sa dvije oštrice u dijabetičkim beta ćelijama. Cell Metab 2018;27:314-31.

13. Fantus D, Rogers NM, Grahammer F, et al. Uloga mTOR kompleksa u bubrezima: implikacije za bubrežnu bolest i transplantaciju. Nat Rev Nephrol 2016;12:587-609.

14. Shiels PG, McGuinness D, Eriksson M, et al. Uloga epigenetike u starenju bubrega. Nat Rev Nephrol 2017;13:471-82.

15. Orhon I, Dupont N, Zaidan M, et al. Autofagija zavisna od primarnog cilijuma kontroliše volumen epitelnih ćelija kao odgovor na protok tečnosti. Nat Cell Biol 2016;18:657-67.

16. Grahammer F, Nesterov V, Ahmed A, et al. mTORC2 kritički reguliše rukovanje bubrežnim kalijem. J Clin Invest 2016;126:1773-82.

17. MacKeigan JP, Krueger DA. Razlikovanje mTOR inhibitora everolimusa i sirolimusa u liječenju kompleksa tuberozne skleroze. Neuro Oncol 2015;17:1550-9.

18. Menezes LF, Germino GG. Patbiologija policistične bolesti bubrega sa metaboličkog stanovišta. Nat Rev Nephrol 2019;15:735-49.

19. Gui Y, Lu Q, Gu M, et al. Fibroblast mTOR/PPARgamma/HGF osovina štiti od smrti tubularne ćelije i akutne povrede bubrega. Cell Death Differ 2019;26:2774-89.

20. Choueiri TK, Je Y, Sonpavde G, et al. Incidencija i rizik od smrtnosti uzrokovane liječenjem kod pacijenata s karcinomom koji su liječeni inhibitorima rapamicina na sisavcima. Ann Oncol 2013;24:2092-7.

21. Gimpel C, Bergmann C, Bockenhauer D, et al. Izjava međunarodnog konsenzusa o dijagnostici i liječenju autosomno dominantne policistične bolesti bubrega kod djece i mladih. Nat Rev Nephrol 2019;15:713-26.

22. Allison SJ. Glomerularna bolest: mTOR u FSGS. Nat Rev Nephrol 2017;13:260.

23. van Eck NJ, Waltman L. Grupiranje publikacija zasnovano na citatima koristeći CitNetExplorer i VOSviewer. Scientometrics 2017;111:1053-70.

24. Chen C, Song M. Vizualizacija polja istraživanja: Metodologija sistematskih scientometrijskih pregleda. PLoS One 2019;14:e0223994.

25. Schargus M, Kromer R, Druchkiv V, et al. 100 najboljih radova u suhom oku - Bibliometrijska analiza. Okul Surf 2018;16:180-90.

26. Sugimoto CR, Ahn YY, Smith E, et al. Faktori koji utiču na izvještavanje o spolu u medicinskim istraživanjima: međudisciplinarna bibliometrijska analiza. Lancet 2019;393:550-9.

27. Fedewa MV, Hathaway ED, Ward-Ritacco CL. Učinak vježbanja na C reaktivni protein: sistematski pregled i meta-analiza randomiziranih i nerandomiziranih kontroliranih studija. Br J Sports Med 2017;51:670-6.

28. Yu L, McPhee CK, Zheng L, et al. Prestanak autofagije i reformacija lizosoma regulirana mTOR-om. Nature 2010;465:942-6.

29. Siegel RL, Miller KD, Jemal A. Statistika raka, 2019. CA Cancer J Clin 2019;69:7-34.

30. Haas NB, Appleman LJ, Stein M, et al. Inhibicija autofagije radi povećanja inhibicije mTOR: ispitivanje Everolimusa i hidroksihlorokina faze I/II kod pacijenata s prethodno liječenim karcinomom bubrežnih ćelija. Clin Cancer Res 2019;25:2080-7.

31. Xu J, Pham CG, Albanese SK, et al. Mehanički različiti mTOR aktivacijski klasteri povezani s rakom predviđaju osjetljivost na rapamicin. J Clin Invest 2016;126:3526-40.

32. Linehan WM, Schmidt LS, Crooks DR, et al. Metabolička osnova raka bubrega. Cancer Discov 2019;9:1006-21.

33. Hudes G, Carducci M, Tomczak P, et al. Temsirolimus, interferon alfa ili oboje za uznapredovali karcinom bubrežnih stanica. N Engl J Med 2007;356:2271-81.

34. Serra AL, Poster D, Kistler AD, et al. Sirolimus i rast bubrega kod autosomno dominantne policistične bolesti bubrega. N Engl J Med 2010;363:820-9.

35. Shillingford JM, Murcia NS, Larson CH, et al. Put mTOR reguliše policistin-1, a njegova inhibicija preokreće bubrežnu cistogenezu kod policistične bolesti bubrega. Proc Natl Acad Sci USA 2006;103:5466-71.

36. Guo Z, Hong SY, Wang J, et al. Makrociklusi inspirirani rapamicinom s novom specifičnošću cilja. Nat Chem 2019;11:254-63.

37. Budde K, Becker T, Arns W, et al. Režim bez inhibitora kalcineurina na bazi Everolimusa kod primatelja de-novo transplantacije bubrega: otvoreno, randomizirano, kontrolirano ispitivanje. Lancet 2011;377:837-47.

38. Henske EP, Jozwiak S, Kingswood JC, et al. Kompleks tuberozne skleroze. Nat Rev Dis Primers 2016;2:16035.

39. Narita M, Young AR, Arakawa S, et al. Prostorno spajanje mTOR-a i autofagije povećava sekretorne fenotipove. Science 2011;332:966-70.

40. Natoli TA, Smith LA, Rogers KA, et al. Inhibicija akumulacije glukozilceramida rezultira efikasnom blokadom policistične bolesti bubrega kod mišjih modela. Nat Med 2010;16:788-92.

41. Miller JL. Sirolimus odobren sa indikacijom za transplantaciju bubrega. Am J Health Syst Pharm 1999;56:2177-8.

42. StatBite: Odobrenja FDA onkoloških lijekova 2009. J Natl Cancer Inst 2010;102:219.

43. Chiew GGY, Wei N, Sultania S, et al. Bioinženjering trodimenzionalna ko-kultura ćelija raka i endotelnih ćelija: model sistema za dualnu analizu rasta tumora i angiogeneze. Biotechnol Bioeng 2017;114:1865-77.

Zatražite više: david.deng@wecistanche.com