Proteomske i citokinske analize razlikuju slučajeve mijalgijskog encefalomijelitisa/sindroma kroničnog umora od kontrolne skupine 3. dio
Oct 13, 2023
Zašto ćemo biti umorni? Kako možemo riješiti probleme umora?
【Kontakt】E-mail: george.deng@wecistanche.com / WhatsApp:008613632399501/Wechat:13632399501
Cistanche može djelovati kao sredstvo protiv umora i poboljšanja izdržljivosti, a eksperimentalne studije su pokazale da dekocija Cistanche tubulosa može učinkovito zaštititi hepatocite jetre i endotelne stanice oštećene kod miševa koji plivaju s teretom, pojačati ekspresiju NOS3 i promovirati glikogen u jetri. sintezu, čime se postiže efikasnost protiv umora. Ekstrakt Cistanche tubulosa bogat feniletanoidnim glikozidima može značajno smanjiti serumsku kreatin kinazu, laktat dehidrogenazu i nivoe laktata i povećati nivo hemoglobina (HB) i glukoze kod ICR miševa, a to bi moglo igrati ulogu protiv umora smanjujući oštećenje mišića i odgađanje obogaćivanja mliječne kiseline za skladištenje energije kod miševa. Tablete Compound Cistanche Tubulosa značajno su produžile vrijeme plivanja za nošenje težine, povećale rezervu glikogena u jetri i smanjile nivo uree u serumu nakon vježbanja kod miševa, pokazujući svoj efekat protiv umora. Uvarak od cistanchisa može poboljšati izdržljivost i ubrzati otklanjanje umora kod miševa koji vježbaju, a može smanjiti i povišenje serumske kreatin kinaze nakon opterećenja i održati ultrastrukturu skeletnih mišića miševa normalnom nakon vježbanja, što ukazuje da ima efekte za jačanje fizičke snage i protiv umora. Cistanchis je također značajno produžio vrijeme preživljavanja miševa otrovanih nitritima i poboljšao toleranciju na hipoksiju i umor.
Kliknite na Uvijek umoran
Viši nivoi drugog proteina povezanog sa hemostazom, PROS1, su u korelaciji sa lošijim zdravljem u kontrolama, ali nemaju značajnu povezanost sa ME/CFS kohortom (slika 7a). PROS1, takođe poznat kao Protein S, je dobro poznati regulator hemostaze, sa važnim antikoagulansnim efektima [62]. Činjenica da to nije u korelaciji sa zdravljem pacijenata sa ME/CFS može odražavati poremećenu kontrolu hemostaze u bolesti.
Viši nivoi CETP-a, proteina za prijenos holesteril estera, povezani su sa povećanim umorom na MFI-20 (slika 7a). Ovaj protein kontrolira razmjenu estera holesterola i triglicerida između HDL-a i lipoproteina niske gustine (LDL), a očekuje se da će viši CETP rezultirati manje povoljnim omjerom LDL/HDL, što je povezano sa srčanim oboljenjima [63]. Uočeno je da imunološke ćelije kod pacijenata sa ME/CFS pokazuju izmijenjenu oksidaciju masnih kiselina, što bi moglo biti povezano s razlikama u sastavu masnih kiselina u plazmi [64].
Viši nivoi SERPINA5 bili su povezani sa boljim rezultatima na skali opšteg zdravlja i socijalnog funkcionisanja SF-36 (Slika 7b). SERPINA5 je izlučeni inhibitor serin proteaze čije funkcije nisu u potpunosti shvaćene [65]. Prvobitno je identificiran kao inhibitor antikoagulantnog proteina C aktiviranog proteazom [66]. Iako ova činjenica sugerira da veći SERPINA5 može povećati koagulaciju, in vitro studija je pokazala da SERPINA5 može poslužiti i kao antikoagulant i kao prokoagulant ovisno o prisutnosti trombomodulina [67]. Trombociti sadrže SERPINA5 mRNA i mogu preuzeti protein iz vanjskog miljea [68]. Naše finansiranje korelacije zdravstvenog statusa ME/CFS sa proteinom uključenim u hemostazu može biti relevantno za nedavna otkrića aktiviranih trombocita i mikrougrušaka u ME/CFS [69], kao i za promijenjene profile ekspresije trombocita [52]. Nadalje, varijante gena SERPINA5 su ranije bile povezane sa ME/CFS [70].
Korelacije sa nekoliko proteina otkrivene su kroz robusnu linearnu regresiju koja nije pronađena preko Spearmanove korelacije (Tablica 3). CSF3, također poznat kao faktor stimulacije kolonije granulocita, povećava se s godinama u ME/CFS kohorti, ali je niži s godinama u ukupnoj kohorti, što možda ukazuje na inflamatorno stanje u kohorti pacijenata. EV hemokin CXCL1, koji privlači neutrofile u regije infekcije ili ozljede, smanjuje se s godinama u ukupnoj kohorti. Predviđa se da će PFN1, profilin{5}}, koji reguliše polimerizaciju aktina, biti veći kod muškaraca u ukupnoj kohorti, ali niži kod muškaraca sa ME/CFS.
Koristili smo klasifikatore mašinskog učenja da identifikujemo proteine koji razlikuju slučajeve i kontrole. Prethodno je skup podataka o proteomici bio podvrgnut sličnoj analizi koristeći LASSO, Random Forest i XGBoost [14]. Sedam proteina je zajednički na 20 najboljih lista sve tri metode mašinskog učenja. Pored EV IL2, postojali su CAMP, IGLV1-47, CRTAC1, LRG1, IGF1 i TUBA1. Četiri od njih su takođe bila u grupi od 8 proteina koji su bili zajednički za tri metode u prethodnoj studiji koja je analizirala samo podatke o proteomici plazme [14]. IGF1 i TUBA1ABC nisu bili u prvih 20 kada je ukupna kohorta razmatrana u prethodnoj studiji. Među sedam uobičajenih proteina, samo su EV IL2 i CAMP (Cathelicidin AntiMicrobial Protein) povećani u slučajevima u odnosu na kontrolu, i oba su proinflamatorna. Značaj smanjenja ILGVI- 47 (Imunoglobulin Lambda Variable 1-47) u slučajevima je teško predvidjeti, ali može odražavati neki nepoznati genotipski efekat na osjetljivost na ME/CFS. CRTAC1 (Kiseli protein hrskavice 1) je protein ekstracelularnog matriksa nepoznate funkcije, ali poboljšan rast dermalnih fibroblasta in vitro, tako da niži nivoi mogu biti štetni. LRG1 (Leucine Rich Alpha-2-Glikoprotein 1) se luči iz hepatocita i neutrofila, a viši nivoi su povezani sa korisnim funkcijama (podstiču zacjeljivanje rana), ali i sa raznim bolestima; stoga je značaj njegovog smanjenja nepoznat [71]. Niži nivoi IGF1 (inzulinu sličan faktor rasta 1) vjerovatno će biti nepovoljni za zdravlje, s obzirom na njegova svojstva koja podstiču rast i efekte na metabolizam [72, 73]. TUBA1A, TUBA1B i TUBA1C geni kodiraju tubulin, bitnu komponentu citoskeleta [74]. Tubulinska signalizacija je poremećena nakon kemoterapije i pretpostavlja se da ima ulogu u neurokognitivnom oštećenju koje često nastaje nakon liječenja [75].
IL2 koji se nalazi u EV nalazi se na sve tri liste. IL2 je bio jedini EV citokin koji je razlikovao slučajeve i kontrole na q<0.05 (Fig. 3). In our prior pilot study of EV cytokines in 35 cases and 35 controls, we did not find any significant difference in IL2 between cohorts [25]. Other EV cytokines that featured in the top 20 are VEGF, NGFB, IL15, CXCL8, CXCL10, CCL5, and CCL7, although VEGF, IL15, and CXCL10 did not discriminate cases and controls at q<0.2, according to Wilcoxon tests (Fig. 3). Plasma cytokines IL7, TNFα, IL12p70, and IL22 were included on one or two of the top 20 lists. While no significant differences in any plasma cytokines were detected following correction for multiple testing, before correction TNFα was increased in cases at p=0.016 [26]. Previously, Hornig et al. [41], who performed a larger study, with 298 cases and 348 controls, did not find significant differences between cases and controls for these cytokines. The cytokine profiling literature in ME/CFS has not resulted in consistent conclusions regarding altered cytokine levels between ME/CFS and controls.
Ovaj rad ima neka ograničenja. Prvo, naša studija ima malu veličinu uzorka, posebno s obzirom na heterogenost simptoma bolesti i kada se mjeri veliki broj varijabli. Robusnost naših nalaza treba provjeriti u raznovrsnijim i većim kohortama.
Iako ME/CFS ima veći teret bolesti kod žena [76] i nedavno je otkriven sve veći broj spolnih razlika u njegovoj patofiziologiji [77, 78], nismo bili u mogućnosti prijaviti razvrstane podatke o spolu u našoj studiji zbog ograničenja veličine uzorka. (8 i 9 muškaraca u poređenju sa 41 i 40 žena za kontrolnu i ME/CFS populaciju, respektivno). Stoga statistička poređenja među spolovima nisu bila izvodljiva u našoj trenutnoj studiji.
Ova studija je ispitivala samo perifernu krv i nije analizirala druge odjeljke kao što je cerebrospinalna tekućina. Međutim, uprkos maloj veličini uzorka, abnormalnosti u proteinima pacijenata sa ME/CFS identifikovane su u studijama cerebrospinalne tečnosti [9, 46, 79]. Buduća proteomska istraživanja periferne krvi pacijenata sa ME/CFS bi trebala težiti uspostavljanju korelacije s ovim nalazima.
Ovdje je mjerenje citokina u plazmi i EV-ima obavljeno korištenjem različitih multipleksnih testova. Konkretno, 61-plex iz Affymetrixa je korišten za analizu citokina u uzorcima plazme, dok je 48-plex iz Biorada korišten za mjerenje sadržaja citokina u EV.
Odlučili smo se za metodu precipitacije za izolaciju EV zbog ograničene zapremine uzorka (500 ul) i da bismo omogućili analizu kompletne populacije EV. Upotreba reagensa za taloženje ExoQuick ima tendenciju da postigne nižu čistoću za EV izolovane frakcije u poređenju sa drugim metodama kao što su ultracentrifugiranje i hromatografija isključivanja veličine. Buduće studije koje uspoređuju ove metode u analizi citokina bit će informativne kako bi se osiguralo da su naši rezultati ponovljivi korištenjem drugih metoda izolacije EV. Nadalje, EV nisu razdvojeni na različite frakcije po veličini ili prisutnosti određenih površinskih molekula kako bi se omogućila analiza ovih frakcija odvojeno. Zasigurno će se pojaviti različiti obrasci koji ukazuju na selektivno pakovanje specifičnih proteina u specifične EV.
Treba napomenuti da korelacije objavljene u ovoj studiji ne ukazuju na uzročno-posledične veze i da su potrebna dalja istraživanja kako bi se utvrdila uzročnost. Na primjer, budući da ishrana ispitanika nije bila kontrolirana u ovoj studiji, razlike u profilima citokina između različitih grupa mogu se pripisati razlikama u njihovoj ishrani [80–82]. Stoga ne možemo isključiti mogućnost da su faktori ishrane utjecali na naše rezultate.
U konačnici, budući da je ova studija koristila pristup poprečnog presjeka; ispitivanje longitudinalnih promjena u električnim vozilima zahtijevalo bi dalje istraživanje. Štaviše, jednokratno prikupljanje uzoraka sprečava utvrđivanje da li povezanost simptoma i profila proteina u plazmi i EV pacijenata sa ME/CFS potiče od progresije bolesti. Buduća istraživanja su ključna da bi se utvrdilo da li pacijenti sa ME/CFS konstantno pokazuju specifičan potpis citokina i klasifikaciju ozbiljnosti bolesti tokom vremena, ili ovi faktori fluktuiraju.
Zaključci
Ovaj rad pokazuje važnost prikupljanja kliničkih podataka kako bi se utvrdilo da li su određeni molekuli u korelaciji sa stanjima ispitanika, omogućavajući da se o njima izvedu zaključci čak i ako se njihove srednje vrijednosti malo razlikuju između slučajeva i kontrola. Ponovo smo pokazali da se signalne mreže citokina/hemokina u cirkulaciji mijenjaju između slučajeva ME/CFS i kontrola. Konačno, identifikovali smo 20 proteina čiji nivoi su obezbedili veoma visoku osetljivost i specifičnost za razlikovanje ME/CFS i kontrolnih uzoraka. Podskup od 7 od 20 proteina koji se lakše može upravljati i dalje omogućava značajno odvajanje pacijenata od kontrola (AUROC=0.891, slika 8). Ovi nalazi čekaju potvrdu u većem skupu podataka kako bi se utvrdilo mogu li biti klinički korisni za dijagnozu ili praćenje odgovora na liječenje.
Skraćenice
ME/CFS mijalgični encefalomijelitis/sindrom hroničnog umora
EVs Ekstracelularni vezikuli
Analiza praćenja NTA nanočestica
Analiza glavnih komponenti PCA
SF-36 Kratak obrazac 36 zdravstvena anketa
MFI{0}} Višedimenzionalna skala inventara zamora
AUC Površina ispod krive
BMI Indeks tjelesne mase
IBS Sindrom iritabilnog crijeva
LASSO Operater najmanjeg apsolutnog skupljanja i odabira
FDR-ova stopa lažnog otkrića
AUROC Područje ispod karakteristične krivulje prijemnika
Priznanja
Ovaj rad je koristio opremu u Cornell NanoScale Science & Technology Facility (CNF), članu Nacionalne infrastrukture koordinisane nanotehnologije NNCI), koju podržava Nacionalna naučna fondacija (Grant NNCI-2025233). Zahvaljujemo ME/CFS stručnjacima dr. Lucinda Bateman, Nancy Klimas, Susan Levine i Daniel Peterson za identifikaciju ME/CFS subjekata i kontrola i uzimanje krvi. Zahvaljujemo se svim subjektima na učešću.
Doprinosi autora
Dizajnirano istraživanje (LG, MRH); sprovedeni eksperimenti (JL, LG); analiza podataka (JL, LG); pisanje rukopisa (JL, LG, DR, MRH). MH i WIL su pregledali i uredili rukopis i pružili skupove citokina i proteomskih podataka. JL je izvršio statističku analizu pod nadzorom LG i DR. LG je pregledao JL-ovu analizu i pripremio rukopis. Redoslijed autorstva među koautorima raspoređen je prema obimu rada. Svi autori su pročitali i odobrili konačni rukopis.
Finansiranje
Zahvaljujemo Inicijativi za hronični umor Fondacije porodice Hutchins na podršci prikupljanju uzoraka krvi i podataka istraživanja od ME/CFS i kontrolnih subjekata. Analizu podataka koja je ovdje objavljena finansirao je NIH U54NS105541 za ME/CFS centar Cornell University.
Dostupnost podataka i materijala
Podaci za veličinu ekstracelularnih vezikula, kvantifikaciju i sadržaj citokina dostupni su na zahtjev autorima. Proteomički podaci masene spektrometrije deponovani su u Konzorcijum ProteomeXchange preko PRIDE partnerskog repozitorija sa identifikatorom skupa podataka PXD016622.
Deklaracije
Etičko odobrenje i saglasnost za učešće
Pribavljena je pisana saglasnost svih učesnika i svi protokoli su odobreni od strane Institucionalnog odbora za reviziju pri Medicinskom centru Irving Univerziteta Kolumbija.
Saglasnost za objavljivanje
Svi autori su pregledali i odobrili konačnu verziju za podnošenje.
Konkurentni interesi
Autori izjavljuju da nemaju suprotstavljene interese.
Autor pojedinosti
1 Odsjek za molekularnu biologiju i genetiku, Univerzitet Cornell, 323 Biotechnology Building, 526 Campus Road, Ithaca, NY 14853, SAD. 2 Odeljenje za statistiku i nauku o podacima, Univerzitet Cornell, Ithaca, NY, SAD. 3 Centar za infekcije i imunitet, Škola javnog zdravlja Mailman Univerziteta Columbia, New York, NY, SAD. 4 Odsjek za epidemiologiju, Škola javnog zdravlja Mailman Univerziteta Columbia, New York, NY, SAD. 5 odjela za neurologiju i patologiju, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York, NY, SAD. 6 Škola za operativno istraživanje i informacioni inženjering, Univerzitet Cornell, Ithaca, NY, SAD.
Reference
1. IoM C. Osim mijalgijskog encefalomijelitisa/sindroma hroničnog umora: redefinisanje bolesti. Washington: National Academies Press; 2015.
2. Chia JKS. Uloga enterovirusa u sindromu kroničnog umora. J Clin Pathol. 2005;11:1126.
3. O'Neal AJ, Hanson MR. Enterovirusna teorija etiologije bolesti kod mialgičnog encefalomijelitisa/sindroma kroničnog umora: kritički pregled. Front Med. 2021;8:688486.
4. Hanson MR, Germain A. Pismo uredniku metabolita. Metaboliti. 2020;10(5):216.
5. Davis HE, Assaf GS, McCorkell L, Wei H, Low RJ, Re'em Y, et al. Karakteriziranje dugog COVID-a u međunarodnoj kohorti: 7 mjeseci simptoma i njihov utjecaj. EClinicalMedicine. 2021;38:101019.
6. Sukocheva OA, Maksoud R, Beeraka NM, Madhunapantula SV, Sinelnikov M, Nikolenko VN, et al. Analiza post-COVID-19 stanja i njegovog preklapanja sa mialgičnim encefalomijelitisom/sindromom hroničnog umora. J Adv Res. 2022;40:179–96.
7. Giford EJ, Vahey J, Hauser ER, Sims KJ, Efrd JT, Dursa EK, et al. Bolest u Zalivskom ratu u kohorti i biorepozitorijumu iz ere Zalivskog rata: Kanzas i centri za definicije kontrole bolesti. Life Sci. 2021;278:119454.
8. Baraniuk JN. Pregled jezgara uzlazne mreže uzbuđenja srednjeg mozga i implikacija za mialgični encefalomijelitis/sindrom kroničnog umora (ME/CFS), bolest zaljevskog rata (GWI) i posteksercionalnu malaksalost (PEM). Brain Sci. 2022;12(2):132.
9. Baraniuk JN, Casado B, Maibach H, Clauw DJ, Pannell LK, Hess SS. Proteom povezan sa sindromom hroničnog umora u ljudskoj cerebrospinalnoj tečnosti. BMC Neurol. 2005;5(1):1–19.
10. Schutzer SE, Angel TE, Liu T, Schepmoes AA, Clauss TR, Adkins JN, et al. Različiti proteomi cerebrospinalne tekućine razlikuju lajmsku bolest nakon liječenja od sindroma kroničnog umora. PLoS ONE. 2011;6(2):e17287.
11. Germain A, Ruppert D, Levine SM, Hanson MR. Metaboličko profiliranje kohorte otkrića mijalgijskog encefalomijelitisa/sindroma kroničnog umora otkriva poremećaje u metabolizmu masnih kiselina i lipida. Mol BioSyst. 2017;13(2):371–9.
12. Germain A, Ruppert D, Levine SM, Hanson MR. Prospektivni biomarkeri iz metabolomike u plazmi mialgičnog encefalomijelitisa/sindroma kroničnog umora impliciraju redoks neravnotežu u simptomatologiji bolesti. Metaboliti. 2018;8(4):90.
13. Nagy-Szakal D, Barupal DK, Lee B, Che X, Williams BL, Kahn EJ, et al. Uvid u fenotip mijalgijskog encefalomijelitisa/sindroma kroničnog umora kroz sveobuhvatnu metabolomiku. Sci Rep. 2018;8(1):10056.
14. Milivojević M, Che X, Bateman L, Cheng A, Garcia BA, Hornig M, et al. Proteomsko profiliranje plazme ukazuje na povezanost između ekspanzije klonskih B ćelija vođene antigenom i ME/CFS. PLoS ONE. 2020;15(7):e0236148.
15. Fleshner M, Crane CR. Egzozomi, DAMP i miRNA: karakteristike fiziologije stresa i imunološke homeostaze. Trends Immunol. 2017;38(10):768–76.
16. Barnes BJ, Somerville CC. Moduliranje proizvodnje citokina putem odabranog pakiranja i izlučivanja iz ekstracelularnih vezikula. Front Immunol. 2020;11:1040.
17. Rajendran L, Honsho M, Zahn TR, Keller P, Geiger KD, Verkade P, et al. Kod Alchajmerove bolesti, -amiloidni peptidi se oslobađaju zajedno sa egzosomima. Proc Natl Acad Sci. 2006;103(30):11172–7.
18. Słomka A, Urban SK, Lukacs-Kornek V, Żekanowska E, Kornek M. Velike ekstracelularne vezikule: jesmo li pronašli sveti gral upale? Front Immunol. 2018;9:2723.
19. Yoon YJ, Kim OY, Gho YS. Ekstracelularni vezikuli kao novi međućelijski komunikatori. BMB Rep. 2014;47(10):531.
20. Jung KH, Chu K, Lee ST, Park HK, Bahn JJ, Kim DH, et al. Cirkulirajuće endotelne mikročestice kao marker cerebrovaskularne bolesti. Ann Neurol J Am Neurol Assoc Child Neurol Soc. 2009;66(2):191–9.
21. König L, Kasimir-Bauer S, Bittner AK, Hofmann O, Wagner B, Santos Manvailer LF, et al. Povišeni nivoi ekstracelularnih vezikula povezani su s neuspjehom terapije i progresijom bolesti kod pacijenata s karcinomom dojke koji su podvrgnuti neoadjuvantnoj kemoterapiji. Oncoimunology. 2018;7(1):e1376153.
22. Lee CH, Im EJ, Moon PG, Baek MC. Otkriće dijagnostičkog biomarkera za rak debelog crijeva kroz proteomsko profiliranje malih ekstracelularnih vezikula. BMC Cancer. 2018;18(1):1–11.
23. Castro-Marrero J, Serrano-Pertierra E, Oliveira-Rodríguez M, Zaragoza MC, Martínez-Martínez A, Blanco-López MC, et al. Cirkulirajuće ekstracelularne vezikule kao potencijalni biomarkeri kod sindroma kroničnog umora/mijalgičnog encefalomijelitisa: istraživačka pilot studija. J Ekstracelične vezikule. 2018;7(1):1453730.
24. Eguchi A, Fukuda S, Kuratsune H, Nojima J, Nakatomi Y, Watanabe Y, et al. Identifikacija proteina aktinske mreže, talin-1, i flamina-A, u cirkulirajućim ekstracelularnim vezikulama kao krvni biomarkeri za humani mialgični encefalomijelitis/sindrom hroničnog umora. Brain Behav Immun. 2020;84:106–14.
25. Giloteaux L, O'Neal A, Castro-Marrero J, Levine SM, Hanson MR. Citokinsko profiliranje ekstracelularnih vezikula izolovanih iz plazme kod mialgičnog encefalomijelitisa/sindroma hroničnog umora: pilot studija. J Transl Med. 2020;18(1):387.
26. Nagy-Szakal D, Williams BL, Mishra N, Che X, Lee B, Bateman L, et al. Fekalni metagenomski profili u podgrupama pacijenata sa mialgičnim encefalomijelitisom/sindromom hroničnog umora. Mikrobiom. 2017;5(1):44.
27. Klimas NG, Ironson G, Carter A, Balbin E, Bateman L, Felsenstein D, et al. Nalazi iz kliničke i laboratorijske baze podataka razvijene za otkrivanje patogenih mehanizama kod mialgičnog encefalomijelitisa/sindroma kroničnog umora. Umor Biomed Health Behav. 2015;3:75–96.
28. Fukuda K, Straus SE, Hickie I, Sharpe MC, Dobbins JG, Komarof A. Sindrom hroničnog umora: sveobuhvatan pristup njegovoj definiciji i proučavanju. Međunarodna grupa za proučavanje sindroma hroničnog umora. Ann Intern Med. 1994;121(12):953–9.
29. Carruthers BM, Jain AK, De Meirleir KL, Peterson DL, Klimas NG, Lerner AM, et al. Mijalgični encefalomijelitis/sindrom kroničnog umora: definicija kliničkog radnog slučaja, dijagnostički i tretmanski protokoli. J Sindrom hroničnog umora. 2003;11:7–115.
30. Ware JE Jr, Sherbourne CD. MOS 36-kratka zdravstvena anketa (SF-36): I. Konceptualni okvir i odabir predmeta. Med Care. 1992;30(6):473–83.
31. Smets EM, Garssen B, Bonke B, De Haes JC. Višedimenzionalni inventar umora (MFI) psihometrijski kvaliteti instrumenta za procjenu umora. J Psychosom Res. 1995;39(3):315–25.
32. Fitzgerald W, Freeman ML, Lederman MM, Vasilieva E, Romero R, Margolis L. Sistem citokina inkapsuliranih u ekstracelularnim vezikulama. Sci Rep. 2018;8(1):8973.
33. Huber PJ. Robusna statistika. New York: John Wiley & Sons; 1981.
34. Huber PJ. Robusna procjena parametra lokacije. Ann Math Stat. 1964;35:73–101.
35. Benjamini Y, Hochberg FH. Kontrola stope lažnog otkrivanja: praktičan i moćan pristup višestrukom testiranju. JR Stat Soc. 1995;57(1):289–300.
36. Benjamini Y, Krieger AM, Yekutieli D. Adaptive linear step-up procedure koje kontrolišu stopu lažnog otkrivanja. Biometrija. 2006;3(3):491–507.
37. Breiman L. Slučajne šume. Mach Learn. 2001;45:5–32.
38. Chen T, Guestrin C, urednici. XGBoost: skalabilni sistem za povećanje stabla. U: Zbornik radova 22. međunarodne konferencije ACM SIGKDD o otkrivanju znanja i rudarenju podataka KDD 16; 2016.
39. Tibširani R. Regresijsko skupljanje i selekcija putem lasoa. J Roy Stat Soc Ser B. 1996;58:267–88.
40. Yanez-Mo M, Siljander PR, Andreu Z, Zavec AB, Borras FE, Buzas EI, et al. Biološka svojstva ekstracelularnih vezikula i njihove fiziološke funkcije. J Ekstracelične vezikule. 2015;4:27066.
41. Hornig M, Montoya JG, Klimas NG, Levine S, Felsenstein D, Bateman L, et al. Izraziti imuni potpisi plazme kod ME/CFS prisutni su u ranoj fazi bolesti. Sci Adv. 2015;1(1):e1400121.
42. Castro-Marrero J, Serrano-Pertierra E, Oliveira-Rodriguez M, Zaragoza MC, Martinez-Martinez A, Blanco-Lopez MDC, et al. Cirkulirajuće ekstracelularne vezikule kao potencijalni biomarkeri kod sindroma kroničnog umora/mijalgičnog encefalomijelitisa: istraživačka pilot studija. J Ekstracelične vezikule. 2018;7(1):1453730.
43. Montoya JG, Holmes TH, Anderson JN, Maecker HT, Rosenberg-Hasson Y, Valencia IJ, et al. Citokinski potpis povezan s ozbiljnošću bolesti kod pacijenata sa sindromom kroničnog umora. Proc Natl Acad Sci USA. 2017;114(34):E7150–8.
44. Jason LA, Gaglio CL, Furst J, Islam M, Sorenson M, Conroy KE, et al. Analiza citokinske mreže u pedijatrijskom uzorku pacijenata sa mialgičnim encefalomijelitisom/sindromom hroničnog umora u zajednici. Chronic Illn. 2022.
45. Strawbridge R, Sartor ML, Scott F, Cleare AJ. Inflamatorni proteini se mijenjaju u sindromu kroničnog umora – sistematski pregled i meta-analiza. Neurosci Biobehav Rev. 2019; 107:69–83.
46. Hornig M, Gottschalk G, Peterson D, Knox K, Schultz A, Eddy M, et al. Analiza citokinske mreže cerebrospinalne tekućine kod mialgičnog encefalomijelitisa/sindroma kroničnog umora. Mol Psychiatry. 2016;21(2):261–9.
47. Cheney PR, Dorman SE, Bell DS. Interleukin-2 i sindrom hroničnog umora. Ann Intern Med. 1989;110(4):321.
48. Jason LA, Cotler J, Islam MF, Furst J, Sorenson M, Katz BZ. Analiza citokinskih mreža otkriva dalje razlike između onih koji razviju mijalgični encefalomijelitis/sindrom kroničnog umora nakon infektivne mononukleoze. Umor Biomed Health Behav. 2021;9(1):45–57.
49. Chen D, Dorling A. Kritične uloge trombina u akutnoj i hroničnoj upali. J Thromb Haemost. 2009; 7 (Suppl 1): 122–6.
50. Hercus TR, Broughton SE, Ekert PG, Ramshaw HS, Perugini M, Grimbaldeston M, et al. Porodica GM-CSF receptora: mehanizam aktivacije i implikacije na bolest. Faktori rasta. 2012;30(2):63–75.
51. Boyette LB, Macedo C, Hadi K, Elinof BD, Walters JT, Ramaswami B, et al. Fenotip, funkcija i potencijal diferencijacije podskupina ljudskih monocita. PLoS ONE. 2017;12(4):e0176460.
52. Ahmed F, Vu LT, Zhu H, Iu DSH, Fogarty EA, Kwak Y, et al. Jednoćelijska transkriptomija imunološkog sistema u ME/CFS na početku i nakon izazivanja simptoma. BioRXiv. 2022.
53. Deshmane SL, Kremlev S, Amini S, Sawaya BE. Monocitni hemoatraktantni protein-1 (MCP-1): pregled. J Interferon Cytokine Res. 2009;29(6):313–26.
54. Stringer EA, Baker KS, Carroll IR, Montoya JG, Chu L, Maecker HT, et al. Dnevne fluktuacije citokina, uzrokovane leptinom, povezane su s ozbiljnošću umora kod sindroma kroničnog umora: dokaz upalne patologije. J Transl Med. 2013;11:93.
55. Vazirinejad R, Ahmadi Z, Kazemi Arababadi M, Hassanshahi G, Kennedy D. Biološke funkcije, struktura i izvori CXCL10 i njegov izuzetan dio u patofiziologiji multiple skleroze. NeuroImmunoModulation. 2014;21(6):322–30.
56. Villeda SA, Luo J, Mosher KI, Zou B, Britschgi M, Bieri G, et al. Sistemski milje starenja negativno reguliše neurogenezu i kognitivne funkcije. Priroda. 2011;477(7362):90–4.
57. Patarca R, Klimas NG, Lugtendorf S, Antoni M, Fletcher MA. Disregulirana ekspresija faktora tumorske nekroze u sindromu kroničnog umora: međuodnosi sa ćelijskim izvorima i obrasci ekspresije rastvorljivog imunološkog medijatora. Clin Infect Dis. 1994;18(Suppl 1):S147–53.
58. Moss RB, Mercandetti A, Vojdani A. TNF-alfa i sindrom hroničnog umora. J Clin Immunol. 1999;19(5):314–6.
59. Fruhbeck G, Catalan V, Ramirez B, Valenti V, Becerril S, Rodriguez A, et al. Nivoi IL-1 RA u serumu se povećavaju s gojaznošću i dijabetesom tipa 2 zbog disfunkcije masnog tkiva i smanjuju se nakon barijatrijske operacije paralelno sa adipozom. J Infamm Res. 2022;15:1331–45.
60. Luotola K. Nivoi antagonista IL-1 receptora (IL-1Ra) i upravljanje metaboličkim poremećajima. Nutrienti. 2022;14(16):3422.
61. Fletcher MA, Zeng XR, Barnes Z, Levis S, Klimas NG. Citokini plazme kod žena sa sindromom kroničnog umora. J Transl Med. 2009;7:96.
62. Gierula M, Ahnstrom J. Antikoagulantni protein S-Novi uvidi o interakcijama i funkcijama. J Thromb Haemost. 2020;18(11):2801–11.
63. Taheri H, Filion KB, Windle SB, Reynier P, Eisenberg MJ. Inhibitori proteina prijenosa holesteril estera i kardiovaskularni ishodi: sistematski pregled i meta-analiza randomiziranih kontroliranih studija. kardiologija. 2020;145(4):236–50.
64. Maya J, Leddy S, Gottschalk C, Peterson D, Hanson MR. Promijenjena oksidacija masnih kiselina u populaciji limfocita kod mialgičnog encefalomijelitisa/sindroma kroničnog umora. Int J Mol Med. 2023;24(3):2010.
65. Yang H, Geiger M. SERPINA5 (proteinC inhibitor, PCI): više pitanja nego odgovora. Semin Cell Dev Biol. 2017;62:187–93.
66. Marlar RA, Grifn JH. Nedostatak inhibitora proteina C u bolesti kombinovanog nedostatka faktora V/VIII. J Clin Invest. 1980;66(5):1186–9.
67. Elisen MG, von dem Borne PA, Bouma BN, Meijers JC. Inhibitor proteina C djeluje kao prokoagulant tako što inhibira trombomodulinom induciranu aktivaciju proteina C u ljudskoj plazmi. Krv. 1998;91(5):1542–7.
68. Prendes MJ, Bielek E, Zechmeister-Machhart M, Vanyek-Zavadil E, Carroll VA, Breuss J, et al. Sinteza i ultrastrukturna lokalizacija inhibitora proteina C u ljudskim trombocitima i megakariocitima. Krv. 1999;94(4):1300–12.
69. Nunes JM, Kruger A, Proal A, Kell DB, Pretorius E. Pojava hiperaktiviranih trombocita i fibrinoidnih mikrougrušaka kod mialgičnog encefalomijelitisa/sindroma hroničnog umora (ME/CFS). Pharmaceuticals. 2022;15(8):931.
70. Rajeevan MS, Dimulescu I, Murray J, Falkenberg VR, Unger ER. Genetska evaluacija imunoloških gena i gena povezanih s upalom sa sindromom kroničnog umora usmjerena na put. Hum Immunol. 2015;76(8):553–60.
71. Camilli C, Hoeh AE, De Rossi G, Moss SE, Greenwood J. LRG1: igrač u nastajanju u patogenezi bolesti. J Biomed Sci. 2022;29(1):6.
72. Yakar S, Rosen CJ, Beamer WG, Ackert-Bicknell CL, Wu Y, Liu JL, et al. Nivoi IGF-1 u cirkulaciji direktno regulišu rast i gustinu kostiju. J Clin Invest. 2002;110(6):771–81.
73. Clemmons DR. Relativna uloga hormona rasta i IGF-1 u kontroli osjetljivosti na inzulin. J Clin Invest. 2004;113(1):25–7.
74. Bittermann E, Abdelhamed Z, Liegel RP, Menke C, Timms A, Beier DR, et al. Diferencijalni zahtjevi gena tubulina u razvoju prednjeg mozga sisara. PLoS Genet. 2019;15(8):e1008243.
75. Sordillo PP, Sordillo LA. Misterija mozga kemoterapije: oslobađanje kinurenina, tubulina i biofotona. Anticancer Res. 2020;40(3):1189–200.
76. Valdez AR, Hancock EE, Adebayo S, Kiernicki DJ, Proskauer D, Attewell JR, et al. Procjena prevalencije, demografije i troškova ME/CFS koristeći velike podatke o medicinskim tvrdnjama i mašinsko učenje. Front Pediatr. 2019;6:412.
77. Germain A, Giloteaux L, Moore GE, Levine SM, Chia JK, Keller BA, et al. Metabolomika plazme otkriva poremećen odgovor i oporavak nakon maksimalne vježbe kod mialgičnog encefalomijelitisa/sindroma kroničnog umora. JCI Insight. 2022.
78. Nkiliza A, Parks M, Cseresznye A, Oberlin S, Evans JE, Darcey T, et al. Profili lipida u plazmi specifični za spol pacijenata sa ME/CFS i njihova povezanost s bolom, umorom i kognitivnim simptomima. J Transl Med. 2021;19(1):1–15.
79. Peterson D, Brenu E, Gottschalk G, Ramos S, Nguyen T, Staines D, et al. Citokini u cerebrospinalnoj tekućini pacijenata sa sindromom kroničnog umora/mijalgičnim encefalomijelitisom. Mediat Infamm. 2015;2015:1–4.
80. Manning PJ, Sutherland WH, McGrath MM, De Jong SA, Walker RJ, Williams MJ. Postprandijalne koncentracije citokina i sastav obroka kod gojaznih i mršavih žena. gojaznost. 2008;16(9):2046–52.
81. Netea SA, Janssen SA, Jaeger M, Jansen T, Jacobs L, Miller-Tomaszewska G, et al. Konzumacija čokolade modulira proizvodnju citokina kod zdravih osoba. Citokin. 2013;62(1):40–3.
82. Solis-Pereyra B, Aattouri N, Lemonnier D. Uloga hrane u stimulaciji proizvodnje citokina. Am J Clin Nutr. 1997;66(2):521S-S525.
Napomena izdavača
Springer Nature ostaje neutralan po pitanju jurisdikcijskih zahtjeva u objavljenim mapama i institucionalnim vezama.
【Kontakt】E-mail: george.deng@wecistanche.com / WhatsApp:008613632399501/Wechat:13632399501
