Procjena odnosa između visokoosjetljivog C-reaktivnog proteina i funkcije bubrega korištenjem Mendelove randomizacije u J-MICC studiji u japanskoj zajednici

SAŽETAK

Pozadina: Smatra se da je upala afaktor rizika za oboljenje bubrega. Međutim, da li je upalni status ili uzrok ili ishodhronična bolest bubregaostaje kontroverzna. Cilj nam je bio da istražimo uzročno-posljedičnu vezu izmeđuC-reaktivni protein visoke osjetljivosti(hs-CRP) iprocijenjena brzina glomerularne filtracije(eGFR) koristeći pristupe Mendelove randomizacije (MR).

Metode:U ovoj studiji analiziran je ukupno 10.521 učesnik Japanske multi-institucionalne kolaborativne kohortne studije. Koristili smo MR pristupe sa dva uzorka (ponderisani inverznom varijansom (IVW), ponderisani medijan (WM) i MR-Egger metoda) da bismo procenili efekat genetski određenog hs-CRP na funkciju bubrega. Odabrali smo četiri i tri jednonukleotidna polimorfizma (SNP) povezana s hs-CRP-om kao dvije instrumentalne varijable (IV): IVCRP i IVAsian, na osnovu SNP-a koji su prethodno identificirani u europskim i azijskim populacijama. IVCRP i IVAsian su objasnili 3,4% i 3,9% varijacije u hs-CRP, respektivno.Rezultati:Koristeći IVCRP, genetski određen hs-CRP nije bio značajno povezan saeGFRu IVW i WM metodama (procjena po 1 jedinici povećanja ln(hs-CRP), 0.000; 95% interval pouzdanosti [CI], −0.{{ 7}}19 do 0.020 i −0.003 95% CI, −{{23; }}.019 do 0.014, respektivno). Za IVAsian smo pronašli slične rezultate koristeći IVW i WM metode (procjena, 0.005; 95% CI, −0.{{44} }20 do 0,010 i -0,004 CI, -0,020 do 0,012, respektivno); MR-Egger metoda također nije pokazala uzročne veze između hs-CRP i eGFR (IVCRP: -0,008; 95% CI, -0,058 do 0,042; IVAsian: 0,001; 95% CI, -0,036 do 0,036).

Zaključci:Naše MR analize sa dva uzorka sa različitim IV nisu podržale uzročni efekat hs-CRP na eGFR.

Ključne riječi: hs-CRP; eGFR; Mendelska studija randomizacije;genetska epidemiologija; upala

KLIKNITE OVDJE DA DOBIJETE PRIRODNI ORGANSKI EKSTRAKT CISTANCHE SA 25% EHINAKOZIDA I 9% AKTEOZIDA ZA BUBREŽNU FUNKCIJU

Wecistanche usluga podrške - najveći izvoznik cistanchea u Kini:

Email:wallence.suen@wecistanche.com

Whatsapp/tel:+86 15292862950

Kupite za više detalja o specifikacijama:

https://www.xjcistanche.com/cistanche-shop

UVOD

Sistemska upala se smatra jednom odfaktori rizika za uobičajene hronične bolesti, uključujućidijabetes melitus,1 hipertenzija,2 kardiovaskularne bolesti,3 ihronična bolest bubrega(CKD).4 Generalno,C-reaktivni protein(CRP) se koristi kao biomarker sistemske upale u kliničkim i osnovnim istraživanjima. Iako su prethodne longitudinalne studije ispitivale povezanost između nivoa CRP i CKD u različitim populacijama, dokazi o uzročnosti ove povezanosti i dalje su kontroverzni.5–7 Međutim, neki istraživači su demonstrirali učinak bioloških funkcija orijentiranih na CRP na funkciju bubrega.8, 9 Jedan istraživač je također objavio meta-analizu koja sugerira da bi dodaci vitamina D mogli sniziti nivoe CRP-a u cirkulaciji.10 Sve zajedno, ove studije sugeriraju da intervencije na CRP-u mogu pomoći u poboljšanju funkcije bubrega.

Poslednjih godina,Mendelska randomizacija(MR) pristup privukao je veliku pažnju u genetskoj epidemiologiji. Najveća prednost ove metode je istraživanje uzročne veze između izloženosti (X) i ishoda (Y) iz opservacijskog skupa podataka koristeći genetske varijante kao instrumentalne varijable (G: IV).11 Razvoj MR analize odvijao se uzastopno nakonr identificiranje jednonukleotidnih polimorfizama(SNP) u studijama asocijacija na nivou genoma (GWAS). Kao i kod drugih zdravstvenih ishoda, prethodni GWAS je identifikovao SNP-ove povezane sa nivoima CRP-a, uključujući CRP gen u hromozomu 1.12,13 Zanimljivo je da je poznato da na nivoe CRP-a u serumu utiču genetski polimorfizmi,14 što ukazuje da SNP-ovi povezani sa nivoima CRP-a mogu odražavati dugotrajna izloženost višem=nižem nivou CRP-a. Stoga su SNP-ovi povezani sa nivoima CRP-a u serumu pogodni za IV kako bi se istražile uzročne veze između CRP-a i nekoliko patofizioloških stanja i korištene u prethodnim MR studijama među odraslima u evropskim zemljama.15–17

U azijskim zemljama, velike kohortne studije prikupile su ljudske genome i izvršile genotipizaciju u posljednjih nekoliko decenija. Nekoliko istraživača je sprovelo GWAS i pronašlo nove lokuse povezane sa nivoima CRP-a u azijskim populacijama.18–20 Ove studije omogućavaju istraživačima da sprovedu MR studije koristeći SNP-ove povezane sa CRP-om u azijskim populacijama, što se čini važnim u smislu etničkih razlika. Stoga smo istražili da li su genetski određeni nivoi hs-CRP koristeći dva različita IV, na osnovu SNP identifikovanih u evropskoj i azijskoj populaciji, uzročno povezani safunkciju bubregau japanskoj populaciji koja koristi MR pristupe.

METODE

Studijski predmeti

The study subjects were participants of the Japan Multi-institutional Collaborative Cohort (J-MICC) Study which was conducted in 14 study areas throughout Japan. The purpose of the J-MICC study was to find out the risk factors of cancer and other diseases by examining the relationship between genetic variants, lifestyle habits, blood components, and disease. The eligibility for the J-MICC Study was adults aged 35–69 years living in each study area. The details of the J-MICC Study have been described previously elsewhere and the latest information is available on its website (http:==www.jmicc.com).21,22 The selection process of participants is shown in Figure 1. From the genotyped 14,539 subjects, 26 samples with inconsistent sex information between the questionnaire and an estimate from genotype were excluded. The identity-by-descent method implemented in the PLINK 1.9 software (https:==www.cog-genomics.org=plink2) identified 388 relative pairs (pi-hat >0.1875) and one sample of each pair was excluded. Principal component analysis with a 1,000 Genomes reference panel (phase 3) (http:==www. international genome.org= category=phase-3=) detected 34 subjects whose estimated ancestries were outliers from the Japanese population. The 34 samples were excluded. Among all the remaining 14,091 samples, five subjects withdrew their consent to participate, leaving 14,086 subjects for the final analyses. Of these, the values of serum hs-CRP were available only at three study sites. Therefore, we decided to use a two-sample MR study design, rather than a single sample MR for a smaller dataset. We divided the participants into two groups; 1) 2,503 participants (available for hs-CRP) and 2) 12,501 participants (non-overlapping participants), which are by a basic principle of two-sample MR (nonoverlapping populations with the same ethnicity, similar sex, and age distribution).23 After excluding participants who had an extremely high value for hs-CRP (hs-CRP >3.0 mg=dL, n = 828) and eGFR (eGFR >120 mL=min=1.73 m2, n=3,647), i niže od granice kvantifikacije za hs-CRP (n=8), ukupno 10.521 Japanac (1.667 za genetsku povezanost sa hs-CRP [nazvan kao skup podataka CRP] i 8,854 za genetsku povezanost sa eGFR [nazvanim kao eGFR dataset]) analizirano je u MR-u s dva uzorka ove studije. Od svih učesnika ove studije dobijen je pismeni informirani pristanak. J-MICC studija je provedena uz pridržavanje etičkih smjernica za istraživanje ljudskog genoma i genetskog sekvenciranja. Proceduru ove studije odobrila je Komisija za etičku reviziju Medicinskog fakulteta Univerziteta Nagoya (939-14), Centar za rak u Aichiju i svi istraživački instituti. Analize smo izvršili koristeći skup podataka verzije 20190728.

Mjerenje hs-CRP i eGFR

Uzorci seruma su uzeti od svih učesnika. Izmjerili smo hs-CRP koristeći nefelometriju poboljšanu lateksom. Serumski kreatinin je mjeren enzimskom metodom. Neki instituti su mjerili kreatinin u serumu Jaffe metodom, a zatim ga transformirali u ekvivalentnu vrijednost enzimske metode. eGFR je izračunat korištenjem japanske jednadžbe koju je predložilo Japansko društvo za nefrologiju: eGFR (mL= min=1.73 m2)=194 × kreatinin u serumu (mg=dL) −1.{{10}}94 × starost −0,287 (× 0,739 za žene).24

Izbor instrumentalnih varijabli

Lista kandidata SNP-ova za IV prikazana je u tabeli 1. Prvo smo odabrali četiri SNP-a (rs3093077, rs1205, rs1130864 i rs1800947) unutar CRP gena koji je korišten kao IV u prethodnim MR studijama.15 U ovoj studiji, ovi SNP-ovi odabrani su kao minimalna podskupina za postizanje raznolikosti na CRP genu u evropskim populacijama i nazvani IVCRP. Zatim smo smatrali da je potrebno odabrati SNP-ove i razviti originalne IV-ove u azijskoj populaciji jer je IVCRP razvijen na osnovu SNP-ova identificiranih kod ljudi evropskog porijekla. Stoga smo pretražili riječ 'CRP' u GWAS katalogu (https:==www.ebi.ac.uk= gwas=) ​​i suzili na studije prema sledeći kriterijumi: 1) studija sprovedena na azijskoj populaciji i 2) studija sa fazom otkrivanja i replikacije. Nakon web-baziranog odabira, konačno smo odabrali 13 SNP-ova. Za 151233628, zbog niske kvalitete imputacije (MAF<0.05 and r2 < 0.3), this SNP was not included in the original J-MICC dataset. Of the remaining 12 SNPs, 6 SNPs (rs12133641, rs9375813, rs2097677, rs79802086, rs2393791, and rs1169284) were excluded because these SNPs were not significantly associated with hs-CRP in our dataset (P > 0.0042 = 0.05=12). Next, rs814295 (GCKR) and rs429358 (APOE) were likely to have pleiotropic effects on kidney function. rs3093059 was excluded due to the high linkage disequilibrium (LD) with rs3093068 in the CRP dataset (r2 > 0.9). Finally, three SNPs (rs30933068, rs7553007, and rs7310409) were included in our analysis and were called as IVAsian (Table 2).

Statistička analiza

To confirm the cross-sectional association between hs-CRP and eGFR, multiple linear regression analysis was performed with adjustments for sex, age, and study sites. We performed two-sample MR approaches after dividing the participants into two datasets (CRP and eGFR datasets) as described above. Methods for two-sample MR were different from the one-sample MR method, which was described in previous methodological papers.25–27 The inversevariance weighted method (IVW) is a conventional approach to estimating a causal effect on a study outcome from different studies in meta-analysis.25 In the setting of MR analysis, the IVW method can provide a combined estimate weighted using the inverse variances of the causal effect of per-allele. However, this method can be biased when a genetic variant violates the assumptions of MR (eg, pleiotropic effect).27 Therefore, we also performed two other methods (the weighted median (WM) and the MR-Egger method) which can provide consistent estimates even under the weaker assumption.25 The MR-Egger analysis is also useful to detect either both directional pleiotropy or violation of the Instrument Strength Independent of Direct Effect (InSIDE) assumption. Additionally, the F-statistic was calculated for each IV from linear regression analyses to test whether IVs are strongly associated with exposure (referred to as relevance assumption).28 We performed linear regression analyses using the lm function in R and included all SNPs used in each IV in models. An arbitrary threshold of F-statistic >10 je korišten kako bi se izbjeglo korištenje slabih genetskih instrumenata u ovoj studiji.29 Sve statističke analize su obavljene korištenjem softvera R verzija 3.5.0 (R Fondacija za statističko računarstvo, Beč, Austrija). Konkretno, R paket "MendelianRandomization" je korišten za MR analize sa dva uzorka.30