Odgovor na intranazalnu suplementaciju Lactococcus Lactis W136 u refraktornom CRS-u povezan je s modulacijom upale ne-tipa 2 i regeneracijom epitela

Opravdanje:

Ranije smo dokumentirali da kod osoba s kroničnim rinosinusitisom (CRS) otpornim na operaciju, intranazalna primjena žive Lactococcus lactis W136, probiotičke bakterije, poboljšava simptome specifične za sinuse, SNOT-22 i mukozni aspekt na endoskopiji, uz pratnju smanjenje sinusnih patogena i povećanje zaštitnih bakterija. Ovaj rad istražuje molekularne mehanizme koji podupiru ova zapažanja koristeći transkriptomiju sluznice sinusa.

Lactococcus lactis je probiotik koji može održavati ljudsko zdravlje regulacijom crijevne mikroflore i jačanjem imuniteta. Slijedeći je odnos između Lactococcus lactis i imuniteta:

1. Pomaže u jačanju imuniteta: Lactococcus lactis može promovirati integritet i imuni odgovor crijevne mukozne barijere i promovirati proliferaciju i aktivaciju imunoloških stanica crijevne sluznice, čime se povećava ljudski imunitet.

2. Smanjite alergijske reakcije: Kada imuni sistem nije u ravnoteži, to će dovesti do alergijskih reakcija. Međutim, Lactococcus lactis može smanjiti pojavu alergijskih reakcija regulacijom stanja aktivacije imunoloških stanica u tijelu.

3. Otpornost na patogene: Lactococcus lactis može inhibirati rast i reprodukciju štetnih bakterija i virusa putem kompetitivnog isključivanja i proizvodnje antibakterijskih supstanci, čime se povećava ljudski imunitet.

Zaključno, prisustvo Lactococcus lactis igra važnu ulogu u ljudskom imunitetu. Ljudi mogu promovirati jačanje imuniteta konzumiranjem hrane bogate L. lactis ili suplementacijom probioticima L. lactis. Stoga moramo poboljšati imunitet i razumjeti važnost imuniteta. Cistanche može poboljšati imunitet. Cistanche sadrži razne biološki aktivne sastojke, kao što su polisaharidi, gljive i Huangli. Ovi sastojci mogu stimulirati različite ćelije imunološkog sistema i povećati njihovu imunološku aktivnost.

Kliknite na zdravstvene prednosti cistanchea

Metoda:

Epitelne četke prikupljene prospektivno kao podstudija. lactisW136 klinička ispitivanja korištena su za ispitivanje epitelnih odgovora na suplementaciju mikrobioma koristeći bioinformatičku analizu analize genske ekspresije bez hipoteze. Uzorci od dvadeset četiri pacijenta sa CRS-om otpornim na medicinsko i hirurško liječenje su prospektivno prikupljeni tokom kliničkog ispitivanja u kojem se procjenjuje učinak 14-dnevnog ispiranja nosa dvaput dnevno sa 1,2 milijarde CFU živih L. lactis W136 probiotičkih bakterija (CRSwNP {{8} }, CRSsNP=7). Endoskopski vođeni sinusni četkici su prikupljeni kao dio inicijalne studije, a četkanje je obavljeno neposredno prije i nakon tretmana. Nakon ekstrakcije RNK, uzorci su procijenjeni pomoću Illumina HumanHT{10}} V4 BeadChip. Izračunata je diferencijalna ekspresija gena i izvršena je analiza obogaćivanja puteva kako bi se identificirali potencijalno implicirani procesi.

Rezultati:

Diferencijalno identificirani transkripti i putevi su procijenjeni za ukupnu populaciju i kliničke fenotipove CRSwNP i CRSsNP. Obrasci odgovora na liječenje bili su slični u svim grupama, što implicira puteve za regulaciju imuniteta i regulaciju epitelnih stanica. Oni liče na obrasce poboljšanja uočenih nakon uspješnog liječenja endoskopskom operacijom sinusa ili azitromicinom.

zaključak:

Profiliranje ekspresije gena nakon primjene živih bakterija na oboljeli sinusni epitel naglašava implikaciju višestrukih komponenti osi barijere upala-mikrobiom-epitela koja je uključena u CRS. Čini se da ovi efekti uključuju i obnavljanje epitela i modulaciju urođenog i adaptivnog imuniteta, podržavajući potencijalni interes ciljanja epitela sinusa i mikrobioma kao potencijalnih CRS terapija.

Uvod

Homeostaza sinusne šupljine je obezbeđena kontinuiranom interakcijom epitelne barijere sa rezidentnom mikrobiotom, koja služi za uslovljavanje ne samo imunoloških odgovora već i diferencijacije i regeneracije epitela. Hronični rinosinusitis (CRS) je upalno stanje gornjih disajnih puteva nejasnog porijekla koje karakterizira poremećaj normalne homeostaze s posljedičnom upalom tkiva, mikrobiomskom disbiozom i disfunkcijom epitela (1) Karakteristične promjene uključuju infiltraciju s promjenjivom mješavinom tipa 2 Inflamatorne ćelije tipa 1/tipa 17 i poremećena funkcija i regeneracija epitela, praćena pratećom mikrobiozom disbioze (2). Uključeno je više patogena, ali Staphylococcus Aureus predstavlja čest i problematičan patogen, posebno u CRSwNP i starijoj populaciji (3). Dok početni događaji koji dovode do razvoja bolesti tek treba da budu identifikovani, veruje se da postojanost ovih promena tkiva odražava disfunkciju tri odbrambena stuba, koji se ponašaju kao osovina epitel-upala-mikrobiom koja obezbeđuje zdravlje sinusne šupljine i njenog epitelna obloga.

Koncept koji se pojavljuje da će uspješno upravljanje bolestima imati utjecaj na sve tri komponente osovine, bilo direktno ili indirektno preko nizvodnih efekata, sugerira da sve tri komponente predstavljaju mete za liječenje CRS-a. Dok je imunološka disfunkcija dugo bila glavni cilj terapije (5), sve je očiglednije da ciljanje na druge komponente osovine, kao što je epitel, također može uspješno modulirati bolest (6) Na primjer, uspješno liječenje ElexacaftorTezacaftor-Ivacaftor Trikafta), novi lijek koji se koristi kod cistične fibroze (CF) koji obnavlja manjak ekspresije CFTR-a, povezan je sa skoro potpunim rješavanjem bolesti sinusa povezanih s CF, što se vidi po poboljšanju simptoma i obnavljanju gotovo normalnog epitelnog aspekta, čak i u odsustvu istovremene terapije antibioticima (7).

S obzirom na uspjeh modulacije epitelne funkcije, modulacija mikrobioma stoga može predstavljati još jednu strategiju, a suplementacija nazalnog mikrobioma intranazalno primijenjenim probiotičkim bakterijama je ranije predložena kao novo sredstvo za liječenje CRS (8, 9). Prethodno smo pokazali da se intranazalna primjena bakterije Lactococcus lactis W136 dobro podnosi i da poboljšava simptome, endoskopski aspekt sluznice i kvalitetu života pacijenata sa CRS (9). Uočeni su i efekti modulacije mikrobioma, s povećanom zastupljenošću Dolosigranulosum Pigrum, navodnog dobrog patobionta koji je nedavno identificiran i kod odraslih i kod djece kao vrsta bakterija povezana sa zdravljem u nosu, sinusima, nazofarinksu i adenoidima. Analiza podgrupa prema kliničkom fenotipu pokazala je smanjenje zastupljenosti Staphylococcus aureus kod pacijenata sa CRSwNP i smanjenje više sojeva Pseudomonas Aeruginosa u CRSsNP (9).

Iako ova intrigantna zapažanja sugeriraju učinak suplementacije mikrobioma na CRS, mehanizmi koji podupiru ove promjene tek treba da budu opisani. Stoga smo željeli dodatno okarakterizirati molekularne mehanizme ovih promjena na nivou tkiva istraživanjem promjena u ekspresiji gena izazvanih tretmanom probiotika L. lactis W136 u sluznici sinusa.

Metode

Učesnici i dizajn studije

Epitelne četke prikupljene prospektivno kao pod-studija kliničkog ispitivanja L. lactis W136 korištene su za ispitivanje epitelnih odgovora na mikrobiom korištenjem bioinformatičke analize analize genske ekspresije bez hipoteze. L. lactis W136 za ispitivanje CRS detaljno je opisan na drugom mjestu (9). Odobrenje je dobiveno od Health Canada za intranazalnu primjenu živih bakterija L. lactis W136 (Registarski broj Health Canada: 191920) i Odbora za institucionalnu reviziju CHUM-a i Etičkog odbora (registracijski broj 12.288) prije izvođenja ispitivanja (Clinicaltrials.gov identifikator: NCT0404 ). Dvadeset četiri pacijenta sa CRS-om otpornim na prethodnu medicinsku i hiruršku terapiju primili su 14-dnevni kurs irigacije sinusa BID koji sadrži 1,2 × 109 CFU živog L. lactis W136. Nijedan pacijent nije primio oralne kortikosteroide ili topikalnu ili sistemsku terapiju antibioticima u prethodnih 30 dana. Dozvoljeno je samo navodnjavanje fiziološkom otopinom za ublažavanje simptoma. Isključeni su pacijenti<18 years, CF, with technical reasons for endoscopic sinus surgery (ESS) failure, active sinus infection with purulence, pain, and/or hyperthermia, or with immune suppression from disease or medication.

Epitelno četkanje je sakupljeno pod endoskopskom kontrolom pomoću četkice za želučanu citologiju na nivou frontalnog udubljenja prije prve primjene probiotika na D0, i dan nakon posljednjeg tretmana na D14. Ukupna RNK je ekstrahovana korišćenjem RNeasy Mini Kit (QIAGEN, Toronto, On, Kanada). Ekspresija gena je izvedena u Genome Quebec Innovation Centru (Montreal, Qc, Kanada) koristeći Illumina HumanHT-12 V4 BeadChip (Illumina, San Diego, CA, Sjedinjene Države).

Analiza podataka o ekspresiji gena

Neobrađeni podaci Illumina sonde izvezeni su iz BeadStudio i testirani na kvalitet. Prethodna obrada i statistička analiza provedene su korištenjem R statističkog jezika i softverskih paketa iz Bioconductor-a kako su opisali Huber et al. (10). Primijenjena je kvantilna normalizacija, praćena log2 transformacijom.

Diferencijalna ekspresija gena

Za svaku sondu ugrađen je upareni linearni model koristeći LIMMA paket iz Bioconductora sa faktorom blokiranja donora. LIMMA paket implementira moderirani t-test koji se koristi za poređenje ekspresije gena prije i nakon intranazalne primjene L. lactis na D0 i D14. P-vrijednosti iz rezultirajuće poređenja prilagođene su za višestruko testiranje prema metodi Benjaminija i Hochberga (11). Ova metoda je kontrolirala stopu lažnog otkrivanja (FDR), koja je bila postavljena na 0.05.

Analiza obogaćivanja puteva

Analiza obogaćivanja skupa gena (GSEA) izvedena je korištenjem paketa FGSEA Bioconductor-a korištenjem skupova gena iz baze podataka molekularnog potpisa (MsigDB, http://www.broad.mit. edu/gsea/msigdb): Hallmark (h.all.v5. 0.symbols.gmt) (12).

P-vrijednosti puteva povezanih sa GSEA su prilagođene za višestruke korekcije testa sa FDR graničnim vrijednostima od 0.05. GSEA je obavljen kako bi se procijenilo da li su poznati biološki put ili skupovi pojedinačnih gena značajno obogaćeni među genima rangiranim moderiranim t-testom nakon analize diferencijalne ekspresije gena.

Rezultati

Kao što je prethodno opisano u kliničkoj studiji, svih 24 pacijenata koji su primali L. lactis W136 su završili studiju (Slika 1) (9). Uključili smo pacijente s upornim simptomima i znacima CRSsNP ili CRSwNP uprkos tome što su bili podvrgnuti tehnički adekvatnoj operaciji i kontinuiranoj primjeni maksimalne medicinske terapije, uključujući irigacije budezonidom velikog volumena nakon operacije („refraktorni“ CRS). Osnovne karakteristike stanovništva navedene su u Endam et al. (9). Sveukupno, 14 dana liječenja L. lactis poboljšalo je simptomatologiju specifičnu za sinus, SNOT-22 rezultat i mukozni aspekt na endoskopiji, uz korisne promjene mikrobioma. Diferencijalna ekspresija gena između uslova prije i nakon tretmana procijenjena je samo za uparene uzorke u (i) svim CRS (N=20), (ii) CRSwNP podgrupi (N=16) (iii) CRSsNP podgrupi (N=4), i (iv) Odgovornici (N=10) (kako je definisano smanjenjem SNOT-22 rezultata od 8,9 ili više). Reagirali su i pacijenti sa CRSwNP (N=8) i CRSsNP (N=2). Transkriptomska procjena je pokazala razlike povezane s liječenjem. Individualni transkripti gena sa FDR manjim ili jednakim 5 posto i većim od ili jednakim 1.2-promjene u ekspresiji su zabilježene samo u grupama "Svi CRS" i u podgrupi CRSwNP (tabela 1 i dopuna materijal). U poređenju sa CRSwNP, ekspresija vrlo malog broja gena je značajno modifikovana nakon tretmana u CRSsNP, verovatno kao posledica malog broja jedinki u toj podgrupi. Ekspresija gena Toplotne karte najvišeg diferencijalno eksprimiranog gena (dodatne slike S1-S4) otkrivaju slične diferencijalne obrasce ekspresije gena za sve populacije, sugerirajući zajednički obrazac odgovora.

Izvršena je analiza obogaćivanja puteva kako bi se identificirali potencijalni osnovni mehanizmi odgovora na liječenje (Slika 2 i Dodatna slika S5). Identifikovani su značajno povezani putevi za sve grupe i otkriveno je da tretman sa Lactococcus Lactis W136 izaziva regulaciju ćelijskog ciklusa, rasta i puteva proliferacije. Dok su obogaćeni karakteristični putevi bili slični između grupa, razlike su bile značajnije u ALL CRS i CRSwNP grupama. Primjetno, čini se da zajednički mehanizam uključuje regulaciju ćelijskog ciklusa i transkripcije (E2F mete, epitelno-mezenhimalni prijelaz, G2M kontrolna točka, MYC mete, lučenje proteina, mitotičko vreteno), regulaciju reaktivnih vrsta kisika (ROS) (hipoksija, ROS put, oksidativna fosforilacija). Modulacija imuniteta je također naznačena povećanjem regulacije signalnih puteva (PI3K-AKT-MTOR signalizacija, MTORC1 signalizacija, TGF beta signalizacija) praćena smanjenjem adaptivnog (odbacivanje alotransplantata) i imunoloških odgovora povezanih s tipom 1- (interferon alfa). odgovor, interferon-gama odgovor). Diferencijalna ekspresija u odabranim značajnim putevima pokazuje dosljedan obrazac poboljšane obnove epitela kao odgovor na probiotski tretman. Pojačanje ovog transkripcionog potpisa u populaciji ograničenoj na SNOT{12}} osobe koje su odgovorile je pokazalo da su oni povezani sa uočenim kliničkim poboljšanjima. Putevi su bili slični između fenotipova CRSsNP i CRSwNP, što ukazuje na zajednički mehanizam djelovanja u obje populacije (Tabela 2). Identifikovani putevi su labavo grupirani u ćelijski ciklus i diferencijaciju, regulaciju reaktivnih vrsta kiseonika (ROS), popravku DNK i puteve povezane sa upalom. Uprkos tome što male grupe ometaju analizu, rezultati pokazuju dosljedan mehanizam odgovora među grupama.

Diskusija

Istražujemo mehanizme koji podupiru odgovor na intranazalnu primjenu živog L. lactis W136 kod pacijenata sa refraktornim CRS-om koristeći transkriptomiju. Ovo nadopunjuje naš prethodno objavljen materijal o promjenama mikrobioma uočenim pri primjeni BID 1,2 milijarde CFU Lactococcus Lactis W136 direktno u nosne i sinusne šupljine (9). Prethodna studija Martenssona et al. (8) prijavili su intranazalnu primjenu mješavine laktobacila dobivenih od pčela, nije primijećena promjena u uzorkovanim medijatorima niti sinonazalnom mikrobiomu. U skorije vreme, Lactobacillus primenjen intranazalno dobro su tolerisali ispitanici CRS, nije bilo kliničke ili mehaničke procene rezultata (9).

Ovaj rad koristi transkriptomske metode za razumijevanje mehaničkih osnova efekata lokalnih probiotika na površinu nosa i sinusa. Opisujemo da je primjena L. lactis povezana s diferencijalnom ekspresijom gena koji uključuje biološke puteve ne samo uključene u regulaciju imuniteta, već i epitelnu regulaciju, kao što sugerira identifikacija puteva koji doprinose proliferaciji stanica, signalizaciji preživljavanja i popravljanju oštećenja DNK . Transkriptomske promjene povezane s probiotskom terapijom L. lactis W136 stoga sugeriraju povoljan učinak na progresiju ćelijskog ciklusa i obnovu epitelne funkcije.

Ćelijski i strukturni integritet je bitan za odgovarajuću funkciju epitelne barijere. Ranije smo dokumentovali da je epitelni odgovor na ranu poremećen u CRS (9). Poboljšanja uočena u ovom kliničkom ispitivanju koja sugeriraju poboljšanu regeneraciju i popravak epitela mogu odražavati poboljšanje ovih procesa.

Izvještavamo da je imunološka funkcija bila konzistentno smanjena nakon tretmana, sa smanjenjem uočenog interferonskog odgovora, infiltracije i aktivacije T stanica i reakcije alografta. Imunološka modulacija je karakteristika probiotika (13), stoga nije iznenađujuće vidjeti da je ovdje prikazana. Signal za modulaciju interferona alfa i gama signalizacije može odražavati smanjenje komponenti koje nisu tipa 2 upalnog CRS odgovora (14), gdje uporno visoki nivoi interferona ispoljavaju štetne efekte narušavajući snagu i koordinaciju naknadnih imunoloških odgovora i ometajući ćelijska funkcija (15). Ove promjene mogu doprinijeti razvoju epitelnih u mezenhimalne prijelazne karakteristike CRS-a (16). Štaviše, visoki nivoi inflamatornih medijatora tipa 1 povezani su sa funkcionalnim defektom u popravci epitela u ćelijama respiratornog epitela (17).

Ovo je u skladu s našim rezultatima. Primjena L. lactis je također bila povezana s diferencijalnom ekspresijom gena koji uključuje biološke puteve uključene u regulaciju epitela, kao što sugerira identifikacija puteva koji doprinose proliferaciji stanica, signalizaciji preživljavanja i popravljanju oštećenja DNK. Transkriptomske promjene povezane s probiotskom terapijom L. lactis W136 stoga sugeriraju povoljan učinak na progresiju ćelijskog ciklusa i obnovu epitelne funkcije. Ćelijski i strukturni integritet je bitan za odgovarajuću funkciju epitelne barijere (18).

Ranije smo dokumentovali da je epitelni odgovor na ranu poremećen u CRS (19). Poboljšanja uočena u ovom kliničkom ispitivanju sugeriraju da poboljšana regeneracija i popravak epitela može odražavati poboljšanje ovih procesa.

Dubina i širina efekata suplementacije probiotika L. lactis W136 na ćelijsku i epitelnu funkciju nisu se očekivali, međutim, oni su u skladu s prethodnim izvještajima koji pokazuju poboljšanu reepitelizaciju keratinocita nakon ranjavanja Lactobacillus rhamnosus GG lizatom u modelu scratch testa (20) i naše evoluirajuće razumijevanje CRS bolesti. Epitelna barijera igra važnu ulogu u procesu bolesti. Pored svoje uloge kao fizičke barijere za patogene i iritanse, epitelne ćelije su odgovorne za pokretanje i koordinaciju odbrambenih odgovora (6). Kako su regeneracija i popravak epitela promijenjeni kod pacijenata sa CRS, povećanje ekspresije gena u više aspekata ćelijskog ciklusa ukazuje na povoljan učinak intranazalne primjene suplemenata L. lactis na obnavljanje funkcije epitelnih stanica i progresiju ćelijskog ciklusa. Ove promjene su uočene nakon samo 14 dana liječenja u poređenju sa dužinom liječenja korištenom u drugim studijama, a to je četiri mjeseca. Stoga se očekuje da će povoljan efekat biti veći uz kontinuiranu suplementaciju L. lactis.

Uzeti zajedno, ovi nalazi pokazuju da primjena L. lactis W136 utiče na višestruke procese koji se protežu izvan imunološke regulacije, sugerirajući efekte na epitelnu barijeru koja potencijalno može modulirati sastav mikrobioma.

Ograničenja studija

Ova studija nije paralelno grupno kontrolirano ispitivanje i nije moguće direktno poređenje s navodnjavanjem samo fiziološkim rastvorom. Ipak, u kliničkom ispitivanju, upotreba samo fiziološkog navodnjavanja tokom perioda uvođenja bila je povezana sa pogoršanjem simptoma CRS-a i pogoršanjem mukoznog aspekta nakon povlačenja lijekova. Takođe, veličina uzorka je relativno mala, posebno u grupama "CRSsNP" i "Responders" koje su manje od "ukupne populacije". Obrazac odgovora je ipak sličan u svim grupama i stoga se rezultati ne smiju odbacivati.

Osim toga, nema podataka o tome da li sam fiziološki rastvor utiče na ekspresiju gena. Dok se pokazalo da navodnjavanje fiziološkim rastvorom ne utiče na sastav mikrobioma kod pacijenata sa CRS (5), to nije procenjeno u komparativnom ispitivanju ekspresije gena. Međutim, pacijenti su već primili dvije sedmice samo ispiranje fiziološkom otopinom tokom 14-dnevnog perioda uvođenja bez ikakve kliničke koristi, tako da je malo vjerovatno da su promjene sekundarne samo fiziološkom otopinom. Na kraju, promjene su procijenjene nakon samo 14 dana liječenja, što je kratak period liječenja, u poređenju s drugim studijama u refraktornom CRS-u (21). Uočeni efekti mogu biti veći uz produženu primjenu.

Zaključak

Transkriptomska procjena sugerira da poboljšanja nakon primjene živih bakterija na oboljeli sinusni epitel u refraktornom CRS-u uključuju više komponenti osi barijere upala-mikrobiom-epitela koja je uključena u CRS. Probiotska terapija L. lactis W136 utječe i na obnavljanje epitela i na modulaciju urođenog i adaptivnog imuniteta, podržavajući potencijalni interes ciljanja epitela sinusa i mikrobioma kao potencijalnih CRS terapija.

Pošalji poruku kući

Transkriptomsko profiliranje sugerira efekte žive probiotičke bakterije Lactococcus lactis W136 na oboljeli sinusni epitel u refraktornom CRS-u uključuje ne samo modulaciju upale tipa 1 i mikrobioma, već također implicira obnavljanje integriteta osi epitelne barijere.

Izjava o dostupnosti podataka

Originalni prilozi predstavljeni u studiji uključeni su u članak/dopunske materijale, dalja pitanja se mogu uputiti odgovarajućem autoru.

Etička izjava

Studije koje su uključivale ljudske učesnike su pregledane i odobrene od strane Health Canada za intranazalnu primenu živih bakterija L. lactis W136 (Registarski broj Health Canada: 191920) i Odbora za institucionalnu reviziju CHUM i Etičkog odbora (registracijski broj 12.288) prije učinak ispitivanja (Clinicaltrials.gov identifikator: NCT04048174). Pacijenti/učesnici su dali pismeni informirani pristanak za učešće u ovoj studiji.

Doprinosi autora

SA-R: Regrutacija pacijenata, analiza podataka, pregled literature, priprema rukopisa. OH: analiza podataka, pregled literature, priprema rukopisa. LEM: Dizajn studije, regrutovanje pacijenata, prikupljanje podataka i rezultati. AF-M: Obrada i analiza podataka o ekspresiji gena i puteva. AP: koncepcija studije, analiza podataka, pregled literature, priprema rukopisa. ARF: analiza podataka, priprema rukopisa. MD: koncepcija studije, dizajn studije, analiza podataka, priprema rukopisa. Svi autori dali su doprinos članku i odobrili dostavljenu verziju.

Finansiranje

MD: Merck istraživački fondovi, Univerzitet McGill, Montreal, Kanada (kliničko ispitivanje probiotika), interni fondovi. CHUM (analiza ekspresije).

Sukob interesa

MD: Vlasnik kapitala, Probionase Therapies Inc. Finansiranje kliničkih ispitivanja: Pfizer, AstraZeneca, GlaxoSmithKline i Sanofi.

Napomena izdavača

Sve tvrdnje izražene u ovom članku isključivo su tvrdnje autora i ne predstavljaju nužno one njihovih pridruženih organizacija ili izdavača, urednika i recenzenata. Izdavač ne jamči niti podržava bilo koji proizvod koji se može ocijeniti u ovom članku ili tvrdnje koje može proizvesti njegov proizvođač.

Dodatni materijal

Dodatna slika S1. Transkriptomska procjena odgovora na intranazalni Lactococcus lactis W136 kod svih pacijenata sa CRS. Toplotna karta top 50 različito eksprimiranih gena sa FDR < 0,05.

Dodatna slika S2. Transkriptomska procjena odgovora na intranazalni Lactococcus lactis W136 u podgrupi kroničnog sinusitisa s nazalnim polipima (CRSwNP). Toplotna karta prvih 50 različito eksprimiranih gena sa FDR < 0,05.

Dodatna slika S3. Transkriptomska procjena odgovora na intranazalni Lactococcus lactis W136 u podgrupi kroničnog sinusitisa bez nazalnih polipa (CRSsNP). Toplotna karta prvih 50 različito eksprimiranih gena sa FDR < 0,05.

Dodatna slika S4. Transkriptomska procjena odgovora na intranazalni Lactococcus lactis W136 u podgrupi ispitanika. Toplotna karta prvih 50 različito eksprimiranih gena sa FDR < 0,05.

Dodatna slika S5. Transkripcijski odgovor na 14 dana Lactococcus lactis W136. Analiza ekspresije genskog skupa (GSEA) odgovora na liječenje. (a) Svi pacijenti sa CRS, (b) hronični sinusitis sa nazalnim polipima (CRSwNP), (c) hronični sinusitis bez nosnih polipa (CRSsNP), (d) Odgovori. Diferencijalna ekspresija u odabranim značajnim putevima pokazuje konzistentan obrazac poboljšane obnove epitela (E2F CILJEVI, EPITELNI MEZENHIMSKI PRIJELAZ, G2M CHECKPOINT, MYC CILJEVI V1, MYC CILJEVI V2, SEKRECIJA PROTEINA, REPARACIJA MITOTIČKOG VRETENA, MITOTIČKI VRETENAC 5. , UV RESPONSE UP), regulaciju reaktivnih vrsta kiseonika (ROS) (HIPOKSIJA, REAKTIVNI PUT VRSTA KISIKA, OKSIDATIVNA FOSFORILACIJA), aktivaciju signalnih puteva (PI3K AKT MTOR SIGNALING, MTORC1 SIGNALING, TGF BETA adaptivni signal) i smanjenje immunog signala u (ODBACIVANJE ALOGRAFTA, INTERFERON ALFA ODGOVOR, INTERFERON GAMMA ODGOVOR). Svi predstavljeni putevi imaju FDR < {{10}}.05. Podaci su predstavljeni kao normalizirani rezultati obogaćivanja (NES) gdje vrijednosti > 0 predstavljaju regulaciju naviše, a vrijednosti < 0 regulaciju na nižu kada se porede osobe koje nisu odgovorile sa odgovorima.

Reference

Hronični rinosinusitis odraslih. Nat Rev Dis Primeri. (2020) 6(1):86. doi: 10.1038/ s41572-020-00218-1

2. Kato A, Schleimer RP, Bleier BS. Mehanizmi i patogeneza kroničnog rinosinusitisa. J Allergy Clin Immunol. (2022) 149(5):1491–503. doi 10.1016/j.jaci. 2022.02.016

3. Fokkens WJ, Lund VJ, Hopkins C, Hellings PW, Kern R, Reitsma S, et al. Evropski pozicijski dokument o rinosinusitisu i nazalnim polipima 2020. Rhinology. (2020) 58 (Suppl S29): 1–464. doi: 10.4193/rhin20.600

4. Maniakas A, Asmar MH, Renteria AE, Nayan S, Alromaih S, Endam LM, et al. Azitromicin u visokorizičnom, refraktornom kroničnom rinosinusitisu nakon endoskopske operacije sinusa i irigacije kortikosteroidima: dvostruko slijepo, randomizirano, placebom kontrolirano ispitivanje. Int Forum Allergy Rhinol. (2021) 11(4):747–54. doi 10. 1002/alr.22691

5. Akdis CA. Hipoteza epitelne barijere predlaže sveobuhvatno razumijevanje porijekla alergijskih i drugih kroničnih nezaraznih bolesti. J Allergy Clin Immunol. (2022) 149(1):41–4. doi 10.1016/j.jaci.2021.11.010

6. Stapleton AL, Kimple AJ, Goralski JL, Mehdi Nouraie S, Branstetter BF, Shaffer AD, et al. Elexacaftor-lumacaftor-ivacaftor poboljšava sinonazalne ishode kod cistične fibroze. J Cist Fibros. (2022) 21(5):792–9. doi 10.1016/j.jcf.2022.03.002

7. Mårtensson A, Greiff L, Lamei SS, Lindstedt M, Olofsson TC, Vasquez A, et al. Učinci bakterijskog mikrobioma mliječne kiseline medonosne pčele na ljudske nazalne simptome, komensale i biomarkere. Međunarodni forum za alergiju i rinologiju (IFAR). (2016) 6(7):956–63. doi 10.1002/alr.21762

8. Mårtensson A, Abolhalaj M, Lindstedt M, Mårtensson A, Olofsson TC, Vásquez A, et al. Klinička efikasnost lokalnog bakterijskog mikrobioma mliječne kiseline kod kroničnog rinosinusitisa: randomizirano kontrolirano ispitivanje. Laringoskop Investig Otolaryngol. (2017) 2(6):410–6. doi: 10.1002/lio2.93

9. Endam L, Alromaih S, Gonzalez E, Madrenas J, Cousineau B, Renteria A, et al. Intranazalna primjena Lactococcus Lactis W136 je sigurna kod pacijenata s kroničnim rinosinusitisom koji su prethodno operirali sinus. Microbiol inficira prednje ćelije. (2020) 10:440. doi 10.3389/climb.2020.00440

10. Huber W, Carey VJ, Gentleman R, Anders S, Carlson M, Carvalho BS, et al. Orkestriranje genomske analize visoke propusnosti uz Bioconductor. Nat Methods. (2015) 12(2):115–21. doi 10.1038/nmeth.3252

11. Benjamini Y, Hochberg Y. Kontrola stope lažnog otkrivanja: praktičan i moćan pristup višestrukom testiranju. JR Stat Soc, B. (1995) 57(1):289–300. doi 10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x

12. Korotkevič G, Suhov V, Sergušičev A. Analiza brzog obogaćivanja genskog skupa. bioRxiv. (2019). doi: 10.1101/060012

13. Raheem A, Liang L, Zhang G, Cui S. Modulacijski efekti probiotika tokom patogenih infekcija s naglaskom na imunološku regulaciju. Front Immunol. (2021) 12:616713. doi 10.3389/femme.2021.616713

14. Delemarre T, Holtappels G, De Ruyck N, Zhang N, Nauwynck H, Bachert C, et al. Značajna neutrofilna upala kao redoviti dio teškog kroničnog rinosinusitisa tipa 2 s nazalnim polipima. J Allergy Clin Immunol. (2021) 147 (1):179–188.e2. doi 10.1016/j.jaci.2020.08.036

15. Matarazzo L, Hernandez Santana YE, Walsh PT, Fallon PG. Porodica IL-1 citokina je čuvar barijernog imuniteta. Citokin. (2022) 154:155890. doi 10.1016/j. do.2022.155890m

16. Li R, Ong SL, Tran LM, Jing Z, Liu B, Park SJ, et al. Ispravka autora: hronična IL-1 -indukovana upala reguliše fenotipove memorije tranzicije epitela u mezenhim putem epigenetskih modifikacija kod karcinoma pluća ne-malih ćelija. Naučna Republika (2020) 10:377. doi: 10.1038/s41598-020-61341-3

17. Maille E, Trinh NTN, Privé A, Bilodeau C, Bissonnette É, Grandvaux N, et al. Regulacija normalnih i cistične fibroze procesa popravke epitela disajnih puteva pomoću TNF-a nakon ozljede. Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. (2011) 301: L945–55. doi 10.1152/a poniranje.00149.2011

18. Hellings PW, Steelant B. Epitelne barijere kod alergije i astme. J Allergy Clin Immunol. (2020) 145(6):1499–509. doi 10.1016/j.jaci.2020.04.010

19. Valera FCP, Ruffin M, Adam D, Maillé É, Ibrahim B, Berube J, et al. Staphylococcus aureus ometa popravku sinonazalnog epitela: efekti kod pacijenata sa hroničnim rinosinusitisom sa nazalnim polipima i kontrolnih subjekata. J Allergy Clin Immunol. (2019) 143(2):591–603.e3. doi 10.1016/j.jaci.2018.05.035

20. Mohammed Saeed W, Cruickshank S, McBain AJ, O'Neill CA. Lactobacillus rhamnosus GG lizat povećava reepitelizaciju testova ogrebotina keratinocita promovišući migraciju. Sci Rep. (2015) 5:16147. doi: 10.1038/srep16147

21. Bachert C, Han JK, Desrosiers M, Hellings PW, Amin N, Lee SE, et al. Efikasnost i sigurnost dupilumaba kod pacijenata sa teškim hroničnim rinosinusitisom sa nazalnim polipima (LIBERTY NP SINUS-24 i LIBERTY NP SINUS-52): rezultati su dva multicentrična, randomizirana, dvostruko slijepa, placebom kontrolirana, paralelna - grupna faza 3 ispitivanja. Lancet. (2019) 394(10209):1638–50. doi: 10.1016/S0140-6736(19)31881-1

For more information:1950477648nn@gmail.com