Dio 3: Aktivacija hipokampalne CREB-pCREB-miRNA MEF2 osi modulira individualnu varijaciju prostornog učenja i sposobnosti pamćenja

Kontakt:joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791

Plc kliknite ovdje do 2. dijela

Jedinstveno, čini se da je miR-466f-3p pozitivan regulator prostornog učenja imemorija(Slike 1 i 3). Sada je dobro utvrđeno da su biogeneza, aktivnost i degradacija specifičnih miRNA uključeni u regulaciju neuronske plastičnosti odgovorne za učenje i dugoročnomemorijaformiranje (McNeill i Van Vactor, 2012), a pogrešna ekspresija nekih od njih povezana je s neurološkim poremećajima (Issler i Chen, 2015; Salta i De Strooper, 2017). Na primjer, kod beskičmenjaka Aplysia California, miR-124 reguliše sinaptičku plastičnost posredovanu serotoninom kroz regulaciju CREB (Rajasethupathy et al., 2009). Uloga miRNA u stresu povezanim, zavisnim od amigdale

Cistanche može poboljšati pamćenje

Slika 6. Stohastička fosforilacija hipokampalnog CREB-a i transkripcijska aktivacija miR-466-669 klastera

(A) Genske mape mSfmbt2 i miR-466-669 klastera. Sekvence koje kodiraju miRNA-prekursor klastera miR-466-669 smještenog u intronu 10 gena mSfmbt2 prikazane su kao sivi okviri. Prvi nukleotid od najviše 50 miRNA prekursora (pre-mir-466m) je označen plus 1. Lokacije različitih dijelova primarnog transkripta miR-466-669 klastera (A–H) pokazuju pozitivne ( plus ) RT-qPCR signali su označeni sivim trakama. Dio I koji ne pokazuje () RT-qPCR signal je označen praznom trakom. TSS, pretpostavljeno početno mjesto transkripcije miR-466-669 klastera.

(B) Relativni nivoi ekspresije hipokampusa mSfmbt2 mRNA GLN miševa, koji pokazuju visoke nivoe miR-466f-3p, u poređenju sa PLN miševima (n=7 po grupi). Ct vrijednosti mSfmbt2 su ~29–32.

(C) Relativni nivoi ekspresije hipokampusa primarnog transkripta miR-466-669 klastera (dijelovi B i G) GLN miševa u poređenju sa PLN miševima (n=10 po grupi).

(D) Western blot analiza ekspresije fosfo-CREB (pCREB), ukupnog CREB (tCREB) i b-aktina u hipokampusu GLN, PLN i HC miševa. Prikazane su reprezentativne mrlje (lijevo), a desni histogram pokazuje relativni pCREB/tCREB omjer nakon normalizacije na b-aktin (n=16 po grupi). (E) Pearsonove korelacijske dijagrame rasipanja pokazuju korelacije između nivoa ekspresije hipokampusa primarnog transkripta miR-466-669 klastera i pCREB/tCREB proteina individualnog GLN (n=18, R=0.52, *p=0.02, tačke) i PLN miševi (n=9, R=0.71, *p=0.03, kvadrati, respektivno). Prosječni nivo za HC miševe (n=9) postavljen je kao 1.

(F) Western blot analiza ekspresije pCREB, tCREB i b-aktina u DIV14 primarnim hipokampalnim neuronima nakon hemijski indukovane LTP (forskolinom) i hemijski inhibirane CREB fosforilacije (666-15). Neuroni su tretirani sa 1 nM ili 2 nM 666-15 tokom 1 h, a zatim tretirani forskolinom 2 h. Histogram pokazuje relativne pCREB/tCREB omjere.

(G i H) Poređenje nivoa ekspresije miR-466f-3p (G) i miR-466-669 primarnog transkripta klastera (H) u DIV14 primarnim neuronima hipokampusa pod {{4} } i tretman forskolinom kao što je opisano u (F). Nurr1 i homer1a mRNA su pozitivne kontrole. RT-qPCR signali dijelova B i G naznačeni u (A) gore korišteni su za predstavljanje primarnog transkripta miR-466-669 klastera.

Podaci prikazani u (B)–(D) su predstavljeni kao srednja vrijednost ± SEM, a podaci iz tri nezavisna seta eksperimenata (n {{0}} po grupi) prikazani u (F) i (G) su prikazani kao srednja vrednost ± SD. Statistička značajnost je procijenjena nesparenim t-testom (B i C), jednom ANOVA sa Tukeyjevim post hoc testom (D, F i G), ili dva-ANOVA sa Tukeyjevim post hoc testom (H). Statističke razlike: *p < 0.05,="" **p="">< 0.01,="" ***p="">< 0,001="" i="" ****p=""><>

učenje straha i izumiranje je jasno prikazano (Ronovsky et al., 2019; Sillivan et al., 2020). Takođe, NOR test povećava ekspresiju miR-183/96/182 u hipokampusu (Woldemichael et al., 2016). Kao miR-124, miR-134 specifičan za mozak negativno reguliše strahmemorijaformiranje i indukcija LTP-a u CA1 regiji hipokampusa glodara kroz translacijsku represiju LimK1 mRNA (Gao et al., 2010). S obzirom na prostorno i prepoznavanje objekatamemorija, miR-132 se inducira modulacijom CREB-a ovisnom o neuronskoj aktivnosti (Hansen et al., 2016). Slično kao kod miR-132, otkrili smo da aktivnost neurona inducira miR-466f-3p kroz transkripcijsku aktivaciju CREB (Slike 6F-6H). Međutim, za razliku od miR-466f-3p, miR-132 se inducira kod miševa sa boljim ili lošim performansama u MWM zadatku (Slike 1BandS1A), vjerovatno zbog miR-132 također može biti izazvan stresom (Shaltiel et al., 2013.), kao što bi bio slučaj tokom dugotrajnog i stresnog MWM zadatka. Još jedan mogući razlog zašto se otkriveni omjeri ne razlikuju u GLN i PLN grupama je ograničenje metode detekcije koju smo koristili, sa visokim bazalnim nivoima miR-132, kao i ERK, ometaju našu sposobnost da detektujemo promjene nabora u rijetkim engramima hipokampalnih lizata. Iako miRNA u miR-466-669 klasteru imaju visok stepen sličnosti sekvenci, samo neki članovi se induciraju tokom MWM treninga (slika 1B), vjerovatno zbog diferencijalne regulacije transkripcije i/ili post-transkripcione regulacije tokom biogeneze miRNA (Michlewski i Ca ´ ceres, 2019; Siomi i Siomi, 2010).

Za razliku od ovih drugih miRNA, miR-466f-3p se u našoj studiji pojavio kao pozitivan regulator plastičnosti neurona preko CREB-pCREB-miR-466f-3p -MEF2A osa (slike 5 i 6). Poznato je da MWM zadatak stimuliše fosforilaciju CREB (Porte et al., 2008). pCREB pozitivno reguliše plastičnost neurona, kao imemorijaalokaciju i konsolidaciju, uglavnom transkripcionom aktivacijom različitih genomskih lokusa/gena (Lisman et al., 2018). Naši in vitro podaci pokazuju da je za ekspresiju miR-466f-3p potrebna aktivacija CREB putem fosforilacije (Slike 6F i 6G). Značajno, paralelno sa povećanim hipokampalnim nivoima miR-466f-3p (Slika 1B), otkrili smo da je CREB aktiviran fosforilacijom GLN, ali ne i PLN, kod miševa (Slika 6D; vidi dolje). Štaviše, naš kombinatorni pristup upotrebe prekomjerne ekspresije posredovane lentivirusom i inhibicije spužve pokazuje da je miR466-3p indukcija primarni uzrok boljeg prostornog učenja imemorijasposobnost (slika 3C). U korelaciji s rezultatima MWM zadatka, miševi koji prekomjerno eksprimiraju miR-466f- 3p u svom hipokampusu pokazali su jači LTP, o čemu svjedoči povećanje fEPSP-a u odnosu na kontrolni ili miR-spužvi virus- inficirani miševi (slika 4B).

Mehanički, miR-466f-3p potiskuje translaciju Mef2a mRNA, čime se smanjuje nivo MEF2A proteina, negativnog regulatora dendritskog rasta kralježnice izazvanog učenjem i prostornogmemorijaformiranje (Cole et al., 2012; Flavell et al., 2006), u hipokampusu GLN miševa (slike 5D, 5F i 5G). Prijavljeno je da MEF2A/2D inhibira indukciju ekscitatornih dendritskih sinapsi (Flavell et al., 2006). Iako su obje ove prethodne studije, koje odražavaju našu studiju ovdje koristeći miR-466f-3p pristupe prekomjerne ekspresije ili inhibicije zasnovane na miR spužvi (Slika 2A), ispitale su dendritsku arborizaciju i prijavile da nema razlika između divljih- tipa i MEF2 prekomjerne ekspresije ili knockdown subjekata, nijedna studija nije analizirala učinak na dužinu dendrita. Ovdje treba spomenuti da iako 30 UTR Mef2d mRNA također sadrži prediktivno mjesto vezivanja za miR-466f-3p, miR-466-f-3p prekomjerna ekspresija nije utiču na aktivnost reportera plazmida koji nosi Mef2d 30 UTR (podaci nisu prikazani). Posebno, Cole et al. (2012) su pokazali da su nivoi MEF2A/D proteina smanjeni u hipokampusu miševa obučenih u vodenom lavirintu. Nadalje, budući da su njihovi obučeni miševi sa kasnijom prekomjernom ekspresijom MEF2 predstavljali normalne prostornememorija, zaključili su da je prekomjerna ekspresija MEF2 posebno poremetila formiranje, ali ne postojeće, prostorne memorije. Međutim, njihova manipulacija memorijom bila je vremenski ograničena, jer vektor herpes simplex virusa (HSV) koji se koristi za ekspresiju transgena obično dostiže vrhunac 2-4 dana nakon mikroinjekcije i nestaje 8-12 dana nakon mikroinjekcije (Cole et al., 2012). S druge strane, koristili smo lentivirus, čija bi DNK bila integrirana u hromozome domaćina, dajući trajnu infekciju koja omogućava dugotrajnu manipulaciju učenjem/memorija(Slika 3). Konačno, mali dio (25 posto) GLN miševa nije pokazao miR-466f-3p indukciju tokom MWM zadatka (Slika 1C), što sugerira da drugi faktori i/ili putevi mogu doprinijeti prostorno učenje imemorijasposobnosti ovih GLN miševa. Procijenili smo miR-335-5p i Sgk mRNA, od kojih su obje različito izražene tokom prostornog učenja i formiranja pamćenja (Capitano et al., 2017; Tsai et al., 2002). Međutim, za razliku od pacova ili CD1 bezbrodnih miševa, nismo uočili nikakve razlike u hipokampalnim nivoima miR-335-5p ili Sgk mRNA GLN miševa u odnosu na PLN miševe (Slike S1A i S5). Stoga se čini da je stohastička aktivacija CREB-pCREB-miR-466f-3p-MEF2A ose glavni uzrok individualne varijacije prostornog učenja imemorijasposobnost naših inbred miševa C57BL/6J.

Stohastička ekspresija gena među genetski identičnim ćelijama, koje djeluju na nivou transkripcije, translacije ili post-translacijske modifikacije, intenzivno je proučavana (Eling et al., 2019; Reinius i Sandberg, 2015). Ova stohastičnost je u osnovi varijabilnosti stanica do stanice u ćelijskim funkcijama i posljedičnoj raznolikosti fenotipskih karakteristika koje se manifestiraju u istom mikrookruženju kao odgovor na podražaje iz okoline tijekom diferencijacije/razvoja (Eling et al., 2019). Dva dobro proučena primjera takve stohastičnosti u ekspresiji gena na ćelijskom nivou su promotor olfaktornog receptora i izbor specifičnog Pcdh promotora u klasteru olfaktornih gena pojedinačnih olfaktornih senzornih neurona sisara, koji se aktiviraju nakon epigenetskog prebacivanja (Magklara, i Lomvardas). ). Stohastička i nepovratna odluka o upotrebi Pcdh promotora rezultat je kombinacije varijacije broja kopija, promjena u metilaciji DNK i nekodirajuće RNA transkripcije (Canzio et al., 2019.). Paralelno, stohastičnost u ekspresiji gena i remodeliranju transdukcije signala u specifičnim tkivima, uključujući hipokampus, među genetski identičnim glodarima je ranije uočena (Alfonso et al., 2002; I GH et al., 2014V). Naša studija predstavlja jedan dokaz koji pokazuje da fenotipske varijacije različitih pojedinaca, posebno varijacije u njihovom prostornom učenju imemorijasposobnost, modulirana je stohastičnošću aktivacije CREB u hipokampusu i posljedičnom transkripcijskom aktivacijom miR- 466-669 klastera, što dovodi do povišenih nivoa specifične miRNA (miR-466f-3p) inhibiranje ekspresije memorijskog negativnog regulatora (MEF2A). Međutim, još uvijek nije jasno da li i druge miRNA koje kodira miR-466-669 klaster također doprinose boljem učenju imemorijasposobnost. Ova fenotipska heterogenost mogla bi biti posljedica ćelijske heterogenosti u hipokampusu, što može dovesti do varijacija u ekspresiji gena engrama izazvane aktivnošću (Jaeger et al., 2018; Rao-Ruiz et al., 2019).

U ovom trenutku, kada i kako se utvrđuje stohastičnost hipokampalne CREB aktivacije na specifične neuronske podražaje nije poznato. Vjerovatno je da postoji mehanizam specifičan za lokus koji dozvoljava stohastički fosforilisanom CREB-u da aktivira promotor miR-466-669 klastera. Međutim, trenutno ne postoji dostupna javna baza podataka na transkripcionom početnom mjestu (TSS) ovog klastera miRNA, a postoji samo jedan potencijalni CREB-vezujući motiv koji se nalazi 5 kb uzvodno od pretpostavljenog TSS-a miR-466-669 klastera . Trenutno nije poznato da li pCREB direktno ili indirektno aktivira ovaj klaster miRNA, kao ni osnovni mehanizmi. Posebno, miR-466-669 klaster postoji samo kod glodara. Međutim, ljudske miRNA has-miR-466 i hsa-miR-3941 imaju slične sekvence sjemena kao mišji mmu-miR-466f-3p i sposobne su za uparivanje baza sa 30 UTR ljudske MEF2A mRNA, kako je predviđeno miRWalk 2.0 (Sticht et al., 2018). Nadalje, pokazalo se da druga poznata ljudska miRNA (hsa-miR-1) negativno reguliše ekspresiju MEF2A (Ikeda et al., 2009). Dakle, stohastička aktivacija CREB-pCREB-miR-466f-3p-MEF2Aaxi koja je otkrivena u ovoj studiji predstavlja opšti mehanizam za stvaranje varijacije unutar vrste prostornog učenja imemorijasposobnost među različitim pojedincima koja bi mogla biti evolucijski korisna za prirodnu selekciju.

STAR plus METODE

Detaljne metode su date u online verziji ovog rada i uključuju sljedeće:

d TABELA KLJUČNIH RESURSA

d DOSTUPNOST RESURSA

B Vodeći kontakt

B Dostupnost materijala

B Dostupnost podataka i koda

d EKSPERIMENTALNI MODEL I DETALJI O PREDMETU

B Životinje

B Ćelijske kulture

d DETALJI METODE

B Zadatak Morrisovog vodenog lavirinta

B Test za prepoznavanje novih objekata (NOR)

B Barnesov labirint (BM) zadatak

Hibridizacija B miRNA mikromreža i RT-qPCR analiza

B Plazmidna konstrukcija

B Transfekcija ćelija i hemijski tretman B miRNA in situ hibridizacija (ISH)

B Priprema proteinskog lizata, western blotting, imunofluorescentno bojenje i slikovna analiza

B Golgijevo bojenje

B Rekombinantna lentivirusna infekcija primarnih neurona hipokampusa miša

B Rekombinantna lentivirusna injekcija mišjeg hipokampusa

B Patch-clamp snimanje cijele ćelije

B Electrophysiology

B Luciferazni reporterski test d KVANTIFIKACIJA I STATISTIČKA ANALIZA

DODATNE INFORMACIJE

Dodatne informacije mogu se naći na mreži na https://doi.org/10.1016/j. celrep.2021.109477.

ZAHVALNICA

Zahvaljujemo Nacionalnom RNAi Core Facility u Academia Sinica za pripremu rekombinantnog lentivirusa, Neuroscience Core Facility u Academia Sinica (AS-CFII-108-106) za tehnike snimanja fEPSP-a i snimanja cijele ćelije u kultiviranim neuronima, te Institutu za molekularne Biology Imaging Core i Bioinformatics Core za tehničku pomoć. Takođe zahvaljujemo dr. Hsien-Sung Huang (Nacionalni tajvanski univerzitet) za pružanje lentivirusnog vektora pFUGW-dsRed. Ovo istraživanje je podržao Medicinski univerzitet Taipei, nagrada Frontier of Science (MOST 107-2321-B-001-016); grantovi Ministarstva nauke i tehnologije (MOST), Tajpej, Tajvan (MOST 108- 2320-B-038-066 i MOST 109-2320-B-038-071); i nagradu za starijeg istraživača od Academia Sinica, Taipei, Tajvan.

DOPRINOSI AUTORA

I.-FW, K.-JT i C.-KJS su osmislili eksperimente. G.-JH je napravio Golgijevo bojenje. I.-FW je uz pomoć YW i Y.-HY izveo sve ostale eksperimente. I.-FW je izvršio analizu podataka. I.-FW i C.-KJS su napisali rukopis.

IZJAVA O INTERESIMA

Autori izjavljuju da nema suprotstavljenih interesa.

INKLUZIJA I RAZLIČITOST

Radili smo na osiguravanju spolne ravnoteže u odabiru neljudskih subjekata. Radili smo na osiguravanju raznolikosti u eksperimentalnim uzorcima kroz odabir ćelijskih linija. Dok smo citirali reference koje su naučno relevantne za ovaj rad, takođe smo aktivno radili na promovisanju rodne ravnoteže na našoj listi referenci.

Primljeno: 27. aprila 2020

Revidirano: 7. juna 2021

Prihvaćeno: 13. jula 2021

Objavljeno: 3. avgusta 2021

REFERENCE

Abraham, WC, Jones, OD, i Glanzman, DL (2019). Je li plastičnost sinapsi mehanizam dugoročnog djelovanjamemorijaskladištenje? NPJ Sci. Learn.4, 9. Alfonso, J., Pollevick, GD, Castensson, A., Jazin, E., i Frasch, ACC (2002). Analiza ekspresije gena u hipokampusu pacova korišćenjem PCR u realnom vremenu otkriva velike međuindividualne varijacije u nivoima ekspresije mRNA. J. Neurosci. Res. 67, 225–234.

Asok, A., Leroy, F., Rayman, JB, i Kandel, ER (2019). Molekularni mehanizmi memorijskog traga. Trends Neurosci. 42, 14–22.

Attar, A., Liu, T., Chan, WT, Hayes, J., Nejad, M., Lei, K., i Bitan, G. (2013). Skraćeni protokol Barnesovog lavirinta otkrivamemorijadeficiti u 4-mjesecima starosti u trostruko transgenom mišjem modelu Alchajmerove bolesti. PLoS ONE8, e80355. Bale, TL (2015). Epigenetsko i transgeneracijsko reprogramiranje razvoja mozga. Nat. Rev. Neurosci. 16, 332–344. Belfield, JL, Whittaker, C., Cader, MZ, i Chawla, S. (2006). Diferencijalni efekti Ca2 plus i cAMP na transkripciju posredovanu MEF2D i cAMP-odgovor elementa koji vezuje protein u hipokampalnim neuronima. J. Biol. Chem. 281, 27724–27732.

Humeau, Y., i Choquet, D. (2019). Sljedeća generacija pristupa za istraživanje veze između sinaptičke plastičnosti i učenja. Nat. Neurosci.

Bendesky, A. i Bargmann, CI (2011). Genetski doprinos raznolikosti ponašanja na interfejsu gen-sredina. Nat. Rev. Genet. 12, 809–820.

Bridi, MS, Hawk, JD, Chatterjee, S., Safe, S., i Abel, T. (2017). Farmakološki aktivatori NR4A nuklearnih receptora poboljšavaju LTP na način ovisan o CREB/CBP. Neuropsychopharmacology 42, 1243–1253.

Canzio, D., Nwakeze, CL, Horta, A., Rajkumar, SM, Coffey, EL, Duffy, EE, Duffie´, R., Monahan, K., O'Keeffe, S., Simon, MD, et al . (2019). Antisense lncRNA transkripcija posreduje u demetilaciji DNK kako bi stohastički protokadherin bio izbor promotora. Ćelija 177, 639–653.e15.

Capitano, F., Camon, J., Licursi, V., Ferretti, V., Maggi, L., Scianni, M., Del Vecchio, G., Rinaldi, A., Mannironi, C., Limatola, C., et al. (2017). MikroRNA-335- 5p modulira prostornomemorijai sinaptička plastičnost hipokampusa. Neurobiol. Naučite. Mem. 139, 63–68.

Casellas, J. (2011). Inbred sojevi miševa i genetska stabilnost: pregled. Životinja 5, 1–7.

Chen, YK, i Hsueh, YP (2012). Protein koji veže kortaktin 2 modulira mobilnost kortaktina i reguliše formiranje i održavanje dendritične kičme. J. Neurosci. 32, 1043–1055.

Chen, YL i Shen, CK (2013). Modulacija mGluR-zavisne translacije MAP1B i endocitoze AMPA receptora pomoću mikroRNA miR-146a-5p. J. Neurosci. 33, 9013–9020.

Chu, JF, Majumder, P., Chatterjee, B., Huang, SL, i Shen, CJ (2019). TDP-43 reguliše spregnute dendritske mRNA transportno-translacione procese u saradnji sa FMRP i Staufen1. Cell Rep. 29, 3118–3133.e6.

Cohen, JE, Lee, PR, Chen, S., Li, W., and Fields, RD (2011). MikroRNA regulacija homeostatske sinaptičke plastičnosti. Proc. Natl. Akad. Sci. USA 108, 11650–11655.

Cole, CJ, Mercaldo, V., Restivo, L., Yiu, AP, Sekeres, MJ, Han, JH, Vetere, G., Pekar, T., Ross, PJ, Neve, RL, et al. (2012). MEF2 negativno reguliše strukturnu plastičnost izazvanu učenjem imemorijaformiranje. Nat. Neurosci. 15, 1255–1264.

Danchin, E´., Charmantier, A., Champagne, FA, Mesoudi, A., Pujol, B., i Blanchet, S. (2011). Izvan DNK: integracija inkluzivnog nasljeđa u proširenu teoriju evolucije. Nat. Rev. Genet. 12, 475–486.

Daugaard, I., i Hansen, TB (2017). Biogeneza i funkcija Ago-asociranih RNA. Trends Genet. 33, 208–219.

Ekstrom, AD, Arnold, AE, i Iaria, G. (2014). Kritički pregled alocentrične prostorne reprezentacije i njenih neuronskih podloga: prema mrežnoj perspektivi. Front. Hum. Neurosci. 8, 803.

Eling, N., Morgan, MD, i Marioni, JC (2019). Izazovi u mjerenju i razumijevanju biološke buke. Nat. Rev. Genet. 20, 536–548.

Flavell, SW, Cowan, CW, Kim, TK, Greer, PL, Lin, Y., Paradis, S., Griffith, EC, Hu, LS, Chen, C., i Greenberg, ME (2006). Regulacija faktora transkripcije MEF2 zavisna od aktivnosti potiskuje broj ekscitatornih sinapsi. Science 311, 1008–1012.

Gao, J., Wang, WY, Mao, YW, Grff, J., Guan, JS, Pan, L., Mak, G., Kim, D., Su, SC, i Tsai, LH (2010). Novi put regulišememorijai plastičnost preko SIRT1 i miR-134. Nature 466, 1105–1109.

Hansen, KF, Sakamoto, K., Aten, S., Snider, KH, Loeser, J., Hesse, AM, Page, CE, Pelz, C., Arthur, JS, Impey, S., i Obrietan, K. (2016). Ciljano brisanje miR-132/-212 oštećujememorijai mijenja transkriptom hipokampusa. Naučite. Mem. 23, 61–71.

Holmes, JR, i Berkowitz, A. (2014). Dendritska orijentacija i grananje razlikuju klasu multifunkcionalnih interneurona kičmene kornjače. Front. Neuralni krugovi 8, 136.

Huang, GJ, Ben-David, E., Tort Piella, A., Edwards, A., Flint, J., i Shifman, S. (2012). Neurogenomski dokazi za zajednički mehanizam antidepresivnih efekata vežbanja i hroničnog fluoksetina kod miševa. PLOS ONE 7, e35901.

Ikeda, S., He, A., Kong, SW, Lu, J., Bejar, R., Bodyak, N., Lee, KH, Ma, Q., Kang, PM, Golub, TR, i Pu, WT (2009). MikroRNA-1 negativno reguliše ekspresiju kalmodulina i Mef2a gena povezanih s hipertrofijom. Mol. Cell. Biol. 29, 2193–2204.

Inoue, K., Hirose, M., Inoue, H., Hatanaka, Y., Honda, A., Hasegawa, A., Mochida, K., i Ogura, A. (2017). MikroRNA klaster specifična za glodare unutar Sfmbt2 gena je utisnuta i neophodna za razvoj placente. Cell Rep. 19, 949–956.

Issler, O., i Chen, A. (2015). Određivanje uloge mikroRNA u psihijatrijskim poremećajima. Nat. Rev. Neurosci. 16, 201–212.

Jaeger, BN, Linker, SB, Parylak, SL, Barron, JJ, Gallina, IS, Saavedra, CD, Fitzpatrick, C., Lim, CK, Schafer, ST, Lacar, B., et al. (2018). Novi transkripcijski potpis izazvan okolinom predviđa reaktivnost neurona sa jednom zubatom granulom. Nat. Commun. 9, 3084.

Jensen, P., Myhre, CL, Lassen, PS, Metaxas, A., Khan, AM, Lambertsen, KL, Babcock, AA, Finsen, B., Larsen, MR, i Kempf, SJ (2017). TNFa utječe na neuroprotektivne signalne puteve sinaptičke plastičnosti u neuronima posredovane CREB-om, što je otkriveno proteomikom i fosfo-proteomikom. Jednom meta 8, 60223–60242.

Kandel, ER (2012). Molekularna biologijamemorija: cAMP, PKA, CRE, CREB-1, CREB-2 i CPEB. Mol. Mozak 5, 14.

Kluiver, J., Gibcus, JH, Hettinga, C., Adema, A., Richter, MK, Halsema, N., Slezak-Prochazka, I., Ding, Y., Kroesen, BJ, i van den Berg, A (2012). Brzo stvaranje mikroRNA spužvi za inhibiciju mikroRNA. PLOS ONE 7, e29275.

Lee, MC, Yu, WC, Shih, YH, Chen, CY, Guo, ZH, Huang, SJ, Chan, JCC, i Chen, YR (2018). Ion cinka brzo inducira toksične, izvan putanje amiloid-b oligomere različite od difuzijskih liganda dobivenih iz amiloida b kod Alchajmerove bolesti. Sci. Rep. 8, 4772.

Leger, M., Quiedeville, A., Bouet, V., Haelewyn, B., Boulouard, M., Schumann-Bard, P., i Freret, T. (2013). Test prepoznavanja objekata kod miševa. Nat. Protoc.8, 2531–2537.

Lisman, J., Cooper, K., Sehgal, M., i Silva, AJ (2018).Memorijaformiranje zavisi i od modifikacija sinaptičke snage specifičnih za sinapse i od povećanja ekscitabilnosti specifičnih za ćeliju. Nat. Neurosci. 21, 309–314.

Locke, ME, Milojević, M., Eitutis, ST, Patel, N., Wishart, AE, Daley, M., i Hill, KA (2015). Varijacija broja genomskih kopija u Mus musculus. BMC Genomics 16, 497.

Lois, C., Hong, EJ, Pease, S., Brown, EJ, and Baltimore, D. (2002). Prenos zametne linije i tkivno-specifična ekspresija transgena dostavljenih lentivirusnim vektorima. Science 295, 868–872.

Loos, M., Koopmans, B., Aarts, E., Maroteaux, G., van der Sluis, S., Verhage, M., i Smit, AB; Neuro-BSIK Mouse Phenomics Consortium (2015). Varijacije u ponašanju unutar soja se dosljedno razlikuju između uobičajenih inbred sojeva miševa. Mamm. Genom 26, 348–354.

Lorsch, ZS, Hamilton, PJ, Ramakrishnan, A., Parise, EM, Salery, M., Wright, WJ, Lepack, AE, Mews, P., Issler, O., McKenzie, A., et al. (2019). Otpornost na stres promovira transkripciona mreža koju pokreće Zfp189- u prefrontalnom korteksu. Nat. Neurosci. 22, 1413–1423.

Magklara, A., i Lomvardas, S. (2013). Stohastička ekspresija gena kod sisara: lekcije iz mirisa. Trends Cell Biol. 23, 449–456.

Malhotra, SS, Suman, P., i Gupta, SK (2015). Obaranje alfa ili beta-humanog korionskog gonadotropina smanjuje fuziju BeWo ćelija smanjenjem PKA i CREB aktivacije. Sci. Rep. 5, 11210.

McNeill, E. i Van Vactor, D. (2012). MikroRNA oblikuju neuronski pejzaž. Neuron 75, 363–379.

Michlewski, G., i Ca´ ceres, JF (2019). Post-transkripcijska kontrola biogeneze miRNA. RNA 25, 1–16.

Oey, H., Isbel, L., Hickey, P., Ebaid, B., i Whitelaw, E. (2015). Genetske i epigenetske varijacije među inbred mišjim leglom: identifikacija međuindividualnih različito metiliranih regija. Epigenetika Chromatin8, 54.

Siegel, G., Obernosterer, G., Fiore, R., Oehmen, M., Bicker, S., Christensen, M., Khudayberdiev, S., Leuschner, PF, Busch, CJ, Kane, C., et al . (2009). Funkcionalni ekran implicira mikroRNA{1}}zavisnu regulaciju de-

Pavlicev, M., Cheverud, JM, i Wagner, GP (2011). Evolucija adaptivnih obrazaca fenotipskih varijacija direktnom selekcijom za evolutivnost. Proc. Biol.

Sci. 278, 1903–1912. Pedersen, CA, Vadlamudi, S., Boccia, ML, i Moy, SS (2011). Varijacije u ponašanju majki kod C57BL/6J miševa: Poređenja ponašanja između odraslih potomaka majki s visokim i niskim štenadima. Front. Psihijatrija2,42. Pitts, MW (2018). Barnes Maze Procedura za prostorno učenje iMemorijaMice. Biol. Protoc. 8, e2774. Porte, Y., Buhot, MC, i Mons, NE (2008). Spatialmemorijau Morrisovom vodenom lavirintu i aktivacija proteina koji veže elemente cikličkog AMP odgovora (CREB) u hipokampusu miša. Naučite. Mem. 15, 885–894. Rajasethupathy, P., Fiumara, F., Sheridan, R., Betel, D., Puthanveettil, SV, Russo, JJ, Sander, C., Tuschl, T., i Kandel, E. (2009). Karakterizacija malih RNK ​​u Apliziji otkriva ulogu miR-124 u ograničavanju sinaptičke plastičnosti putem CREB-a. Neuron 63, 803–817. Rao-Ruiz, P., Couey, JJ, Marcelo, IM, Bouwkamp, ​​CG, Slump, DE, Matos, MR, van der Loo, RJ, Martins, GJ, van den Hout, M., van IJcken, WF , et al. (2019). Engram-specifičan transkriptomski profil konsolidacije kontekstualne memorije. Nat. Commun. 10, 2232. Reinius, B. i Sandberg, R. (2015). Slučajna monoalelna ekspresija autosomnih gena: stohastička transkripcija i regulacija na nivou alela. Nat. Rev. Genet. 16, 653–664. Rogerson, T., Cai, DJ, Frank, A., Sano, Y., Shobe, J., Lopez-Aranda, MF, i Silva, AJ (2014). Sinaptičko označavanje tokom dodjele memorije. Nat. Rev. Neurosci. 15, 157–169. Ronovsky, M., Zambon, A., Cicvaric, A., Boehm, V., Hoesel, B., Moser, BA, Yang, J., Schmid, JA, Haubensak, WE, Monje, FJ, i Pollak, DD (2019). Uloga miR-132 u naučenoj sigurnosti. Sci. Rep. 9, 528. Salta, E., i De Strooper, B. (2017). Nekodirajuće RNA u neurodegeneraciji. Nat. Rev. Neurosci. 18, 627–640. Sastry, L., Johnson, T., Hobson, MJ, Smucker, B., i Cornetta, K. (2002). Titeriranje lentivirusnih vektora: poređenje metoda ekspresije DNK, RNK i markera. Gene Ther. 9, 1155–1162. Schneider, A., Hommel, G., i Blettner, M. (2010). Analiza linearne regresije: 14. dio serije o evaluaciji naučnih publikacija. Dtsch. Arztebl. Int. 107, 776–782. Schneider, CA, Rasband, WS, i Eliceiri, KW (2012). NIH Image to ImageJ: 25 godina analize slike. Nat. Metode 9, 671–675. Shaltiel, G., Hanan, M., Wolf, Y., Barbash, S., Kovalev, E., Shoham, S., i Soreq, H. (2013). Hipokampalna mikroRNA-132 posreduje kognitivne deficite izazvane stresom preko svoje mete acetilholinesteraze. Brain Struct. Funct. 218, 59–72.

Sillivan, SE, Jamieson, S., de Nijs, L., Jones, M., Snijders, C., Klengel, T., Joseph, NF, Krauskopf, J., Kleinjans, J., Vinkers, CH, et al. (2020). MikroRNA regulacija trajne memorije pojačane stresom. Mol. Psihijatrija25, 965–976.

Siomi, H. i Siomi, MC (2010). Posttranskripcijska regulacija biogeneze mikroRNA kod životinja. Mol. Ćelija 38, 323–332.

Sticht, C., De La Torre, C., Parveen, A., i Gretz, N. (2018). miRWalk: Online resurs za predviđanje mjesta za vezivanje mikroRNA. PLoS ONE13, e0206239.

Thomas, KT, Anderson, BR, Shah, N., Zimmer, SE, Hawkins, D., Valdez, AN, Gu, Q., i Bassell, GJ (2017). Inhibicija mikroRNA miR-137 povezane sa shizofrenijom ometa transdukciju neurorazvojnog signala Nrg1a. Cell Rep. 20, 1–12.

Tsai, KJ, Chen, SK, Ma, YL, Hsu, WL, i Lee, EH (2002). sgk, primarni glukokortikoidni gen, olakšavamemorijakonsolidacija prostornog učenja kod pacova. Proc. Natl. Akad. Sci. USA 99, 3990–3995.

Vedell, PT, Svenson, KL i Churchill, GA (2011). Stohastička varijacija obilja transkripta kod C57BL/6J miševa. BMC Genomics 12, 167.

e´gh, MJ, Rausell, A., Loos, M., Heldring, CM, Jurkowski, W., van Nierop, V P., Paliukhovič, I., Li, KW, del Sol, A., Smit, AB , et al. (2014). Nivoi ekstracelularnog matriksa hipokampusa i stohastičnost u ekspresiji sinaptičkih proteina rastu sa godinama i povezani su sa kognitivnim padom ovisnim o starosti. Mol. Cell. Proteomika 13, 2975–2985.

Vorhees, CV, i Williams, MT (2014). Procjena prostornog učenja i pamćenja kod glodara. ILAR J. 55, 310–332.

Wang, IF, Guo, BS, Liu, YC, Wu, CC, Yang, CH, Tsai, KJ, i Shen, CK (2012a). Aktivatori autofagije spašavaju i ublažavaju patogenezu mišjeg modela sa proteinopatijama TAR DNK-vezujućeg proteina 43. Proc. Natl. Akad. Sci. USA 109, 15024–15029.

Wang, W., Kwon, EJ, i Tsai, LH (2012b). MikroRNA u učenju, pamćenju i neurološkim bolestima. Naučite. Mem. 19, 359–368.

Woldemichael, BT, Jawaid, A., Kremer, EA, Gaur, N., Krol, J., Marchais, A., i Mansuy, IM (2016). MikroRNA klaster miR-183/96/182 doprinosi dugoročnoj memoriji na način ovisan o protein fosfatazi 1-. Nat. Commun. 7, 12594.

Xie, F., Li, BX, Kassenbrock, A., Xue, C., Wang, X., Qian, DZ, Sears, RC, i Xiao, X. (2015). Identifikacija snažnog inhibitora transkripcije gena posredovane CREB-om sa efikasnom in vivo antikancerogenom aktivnošću. J. Med. Chem. 58, 5075–5087.